Python 不使用英特尔MKL/BLAS/ATLAS/LAPACK编译numpy

我正在使用

py2exe

转换一个使用

numpy

的脚本，并得到一个非常大的结果文件夹，似乎很多大文件都来自

numpy

包中我没有使用的部分，例如

numpy.linalg

为了减小创建的文件夹的大小，我一直认为我应该在没有英特尔MKL/BLAS/ATLAS/LAPACK的情况下编译

numpy

我该如何改变

编辑
在

C:\Python27\Lib\site packages\numpy\linalg

中，我找到了以下文件：

\u umath\u linalg.pyd

（34MB）和

lapack\u lite.pyd

（18MB），它们在使用

py2exe

时被复制到分发文件夹中。如果可能的话，我希望在仍然能够使用

numpy

数组的情况下消除对这些数组的依赖。包含的另一个大文件位于

C:\Python27\Lib\site packages\numpy\core

中，名为

\u dotblas.pyd

（12MB）。是否也可以将其删除？

根据：

禁用ATLAS和其他加速图书馆 可以在Numpy中使用ATLAS和其他加速库 通过以下方式禁用：

  BLAS=None LAPACK=None ATLAS=None python setup.py build

然而，这些信息似乎已经过时了，因为我发现即使使用这些选项，numpy v1.9.2仍然会自动查找

libopenblas。因此

：

numpy_source_dir/$ BLAS=None LAPACK=None ATLAS=None python setup.py config
...
openblas_info:
  FOUND:
    libraries = ['openblas', 'openblas']
    library_dirs = ['/opt/OpenBLAS/lib']
    language = f77

  FOUND:
    libraries = ['openblas', 'openblas']
    library_dirs = ['/opt/OpenBLAS/lib']
    language = f77
...

一种解决方法是将

site.cfg.example

复制到

site.cfg

，然后对其进行编辑，使相关BLAS/LAPACK库的路径无效：

[openblas]
libraries =
library_dirs =
include_dirs =

当您随后调用

BLAS=None LAPACK=None ATLAS=None python setup.py config

时，您应该会得到一个包含以下内容的输出：

...
openblas_info:
/home/alistair/src/python/numpy/numpy/distutils/system_info.py:594: UserWarning: Specified path  is invalid.
  warnings.warn('Specified path %s is invalid.' % d)
  libraries  not found in []
  NOT AVAILABLE
...

我希望同样的方法也适用于ATLAS和MKL，尽管我没有安装这些库来进行适当的测试

当然，您应该知道，没有加速的BLAS/LAPACK库将对线性代数运算的性能产生很大的不利影响

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更新 正如下面的评论中提到的，您实际上并没有“编译”当前版本的numpy，而是从二进制发行版安装的。我上面给出的方法要求您从源代码构建numpy，这在Windows中不是一件容易的事情（尽管有官方的说明）

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一个更简单的选择是安装Christoph Gohlke网站上提供的

未优化的
numpy二进制文件。
对不起，我看过文档，但我甚至不理解它的意思，它说可以通过
BLAS=None-LAPACK=None-ATLAS=None-python-setup.py-build禁用它-我以为这意味着在命令行中键入它，但这不起作用。另外，在哪里可以找到
site.cfg.example
？我根本不使用任何线性代数模块，只使用数组，我认为数组不会受到影响（至少不会太大？
setup.py
和
site.cfg）。示例
是numpy源目录中的文件。你在用什么平台？您目前如何构建numpy？我使用Windows 10，目前已安装了
numpy
，这是我很久以前安装的。我想在重新安装新的
site.cfg
文件之前需要卸载它吗？或者，在缺少LAPACK库的情况下，我是否可以用其他名称安装它？是的，您可以。更重要的是：您最初是如何安装numpy的？鉴于您使用的是Windows，我敢打赌您可能使用了
.exe
安装程序。然而，为了在没有BLAS/LAPACK的情况下重建numpy（如我的回答所示），您需要能够从源代码编译numpy。这在Windows中不是一件容易的事情（尽管有官方的说明）。您最好的选择可能是从Christoph Gohlke提供的未优化的
二进制文件之一重新安装numpy。