使用python运行bash_profile命令

在我的bash终端中，我可以运行以下命令：

$SCHRODINGER/run volume_calc.py -imae type.mae

这是正确的

然后我尝试在python脚本中运行相同的命令；我尝试了以下方法：

import subprocess
subprocess.run(['$SCHRODINGER/run', 'volume_calc.py', '-imae', 'type.mae'])

这会引发错误：

FileNotFoundError: [Errno 2] No such file or directory: '$SCHRODINGER/run'

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我不知道问题是什么，因为我可以很好地运行基本的bash命令。感谢您的帮助。

除非将

shell

参数传递给

subprocess.run

调用，否则默认情况下不会使用subprocess进行环境变量扩展。这将把参数传递给shell（例如，

bash

），shell将处理所需的扩展和任何其他类似shell的功能

以下是必要的代码更改：

subprocess.run(['$SCHRODINGER/run', 'volume_calc.py', '-imae', 'type.mae'], shell=True)

请注意，值得通读python文档中给出的有关如何使用它的详细信息