用Python制作（循环）系统发育树

我正试图为我的生态学课程制作一个很酷的图表——展示不同种类的微生物是如何相互关联的

我有一个编码系统发育树的

xml

文件

<phyloxml xmlns:xsi="http://www.w3.org/2001/XMLSchema-instance" xmlns="http://www.phyloxml.org" xsi:schemaLocation="http://www.phyloxml.org http://www.phyloxml.org/1.10/phyloxml.xsd">
  <phylogeny rooted="false">
    <clade>
      <clade>
        <name>Methanopyri</name>
      </clade>
      <clade>
        <clade>
          <name>Methanococci</name>
        </clade>
        <clade>
          <clade>
            <clade>
              <name>Thermococci</name>
            </clade>
            <clade>
              <name>Thermoplasmata</name>
            </clade>
          </clade>
          <clade>
            <clade>
              <name>Methanobacteria</name>
            </clade>
            <clade>
              <clade>
                <name>Archaeoglobi</name>
              </clade>
              <clade>
                <clade>
                  <name>Methanomicrobia</name>
                </clade>
                <clade>
                  <name>Haloarchaea</name>
                </clade>
              </clade>
            </clade>
          </clade>
        </clade>
      </clade>
    </clade>
  </phylogeny>
</phyloxml>

我得到以下图像：

我宁愿吃这样的东西：

---

我怎么能这样做呢？我很难找到好的图书馆。

剧情的目的是给人留下深刻印象还是提供信息？如果是后者，那么“无聊”的情节会更好。两者兼而有之，但更多的是为了给人留下深刻印象。没有太多的节点，所以我不认为圆树会是感官过载。这不仅仅是感官过载，更重要的是众所周知的事实，倾斜超过45度的文本是不可读的，所以你必须倾斜你的头来阅读它。但如果你仍然热衷于：

from Bio import Phylo

def build_tree(fname: str):
    """ build a tree from a file """
    tree = Phylo.read(fname, 'phyloxml')
    return tree

if __name__ == '__main__':
    tree = build_tree('microbes.xml')