在python脚本中使用mpirun-np

我想在bash中使用以下命令运行pw.x：mpirun-np4 pw.x

from subprocess import Popen, PIPE

process = Popen( "mpirun -np 4 pw.x", shell=False, universal_newlines=True,
                  stdin=PIPE, stdout=PIPE, stderr=PIPE )
output, error = process.communicate();
print (output);

但它给了我一个错误：

Original exception was:
Traceback (most recent call last):
  File "test.py", line 6, in <module>
    stdin=PIPE, stdout=PIPE, stderr=PIPE )
  File "/usr/lib/python3.6/subprocess.py", line 709, in __init__
    restore_signals, start_new_session)
  File "/usr/lib/python3.6/subprocess.py", line 1344, in _execute_child
    raise child_exception_type(errno_num, err_msg, err_filename)
FileNotFoundError: [Errno 2] No such file or directory: 'mpirun -np 4 pw.x': 'mpirun -np 4 pw.x'

原始异常是：
回溯（最近一次呼叫最后一次）：
文件“test.py”，第6行，在
标准偏差=管道，标准偏差=管道，标准偏差=管道）
文件“/usr/lib/python3.6/subprocess.py”，第709行，在__
恢复信号，启动新会话）
文件“/usr/lib/python3.6/subprocess.py”，第1344行，在执行子进程中
引发子项异常类型（错误号、错误消息、错误文件名）
FileNotFoundError:[Errno 2]没有这样的文件或目录：“mpirun-np 4 pw.x”：“mpirun-np 4 pw.x”

如何在python脚本中使用“mpirun-np…”？

如何更改

shell=False

到

---

当在

Popen

构造函数中有

shell=False

时，它希望

cmd

是一个序列；任何类型的

str

都可以是一个，但是字符串被视为序列的单个元素——这在您的案例中发生，整个

mpirun-np 4 pw.x

字符串被视为可执行文件名

要解决此问题，您可以：

• 使用

  shell=True

  并保持所有其他内容不变，但要注意安全问题，因为这将直接在shell中运行，并且不应对任何不受信任的可执行文件执行此操作

• 对

  Popen

  中的

  cmd

  使用适当的顺序，例如

  list

  ：

  import shlex
  process = Popen(shlex.split("mpirun -np 4 pw.x"), shell=False, ...)
  

---

假设

mpirun

和

shell=False都存在于
路径中，则需要自己将命令行解析为列表

另外，除非
subprocess.run（）
不适合您的需要，否则您可能应该避免直接调用
subprocess.Popen（）

inp = open('input.in')
process = subprocess.run(['mpirun', '-np', '4', 'pw.x'],
    # Notice also the stdin= argument
    stdin=inp, stdout=PIPE, stderr=PIPE,
    shell=False, universal_newlines=True)
inp.close()
print(process.stdout)

如果您使用的是较旧的Python版本，请尝试
子流程。检查输出（）
：拆分您的命令并将其作为列表传递给
Popen
，另请参阅为什么要避免
shell=True
，谢谢您的回答，但它对我不起作用，也不会在输出中显示任何内容。
inp = open('input.in')
process = subprocess.run(['mpirun', '-np', '4', 'pw.x'],
    # Notice also the stdin= argument
    stdin=inp, stdout=PIPE, stderr=PIPE,
    shell=False, universal_newlines=True)
inp.close()
print(process.stdout)