Python 最小SciPy Dockerfile

我有一个Dockerfile，如下所示，应用程序代码被省略：

来自python:3的

#二进制依赖项
运行apt更新和apt安装-y gfortran libopenblas dev liblapack dev
#需要Python软件包
运行python3-mpipinstallmysqlclient numpy-scipy-matplotlib

它工作正常，但生成的图像大小为1.75 GB（而代码约为50 MB）。我怎样才能减少这么大的体积

我还尝试使用Alpine Linux，如下所示：

来自python的

：3-1
#numpy和scipy的二进制依赖关系；尽管第二个也不行
运行apk add--无缓存--虚拟生成依赖项\
gfortran gcc g++libstdc++\
musl-dev-lapack-dev-freetype-dev-python3-dev
#对于mysqlclient
运行apk--无缓存添加mariadb dev
#需要Python软件包
运行python3-mpipinstallmysqlclient numpy-scipy-matplotlib

但是阿尔卑斯山导致了许多不同的奇怪错误。来自上层代码的错误：

File "scipy/odr/setup.py", line 28, in configuration
    blas_info['define_macros'].extend(numpy_nodepr_api['define_macros'])
KeyError: 'define_macros'

---

那么，如何使用上述软件包获得尽可能小（或至少更小）的Python3图像呢？

有几种方法可以使Docker图像更小

使用

python:3-slim

Docker图像作为基础。

-slim

图像不包括编译软件所需的软件包。

• 将Python版本固定到3.8。有些包还没有Python3.9的轮子文件，所以您可能需要编译它们。一般来说，最好使用更具体的标记，因为

  python:3-slim

  标记将在不同的时间点指向不同版本的python

您还可以省略

gfortran

、

libopenblas dev

和

liblapack dev

的安装。这些软件包对于构建numpy/scipy是必需的，但是如果安装了预编译的wheel文件，则不需要编译任何代码

使用

pip install

中的

--no cache dir

禁用缓存。如果不包括此项，则pip的缓存将计入Docker映像大小

mysqlclient的

没有linux控制盘，因此您必须编译它。您可以在一条
运行
指令中安装生成依赖项，安装软件包，然后删除生成依赖项。请记住，
libmariadb3
是此包的运行时依赖项

下面是实现上述建议的Dockerfile。它使Docker映像的大小达到354MB

FROM python:3.8-slim

# Install mysqlclient (must be compiled).
RUN apt-get update -qq \
    && apt-get install --no-install-recommends --yes \
        build-essential \
        default-libmysqlclient-dev \
        # Necessary for mysqlclient runtime. Do not remove.
        libmariadb3 \
    && rm -rf /var/lib/apt/lists/* \
    && python3 -m pip install --no-cache-dir mysqlclient \
    && apt-get autoremove --purge --yes \
        build-essential \
        default-libmysqlclient-dev

# Install packages that do not require compilation.
RUN python3 -m pip install --no-cache-dir \
      numpy scipy pandas matplotlib

---

使用alpine linux是个好主意，但alpine使用muslc而不是glibc，因此它与大多数pip控制盘不兼容。结果是您必须编译numpy/scipy。

您可以做一些事情来缩小Docker图像

使用

python:3-slim

Docker图像作为基础。

-slim

图像不包括编译软件所需的软件包。

• 将Python版本固定到3.8。有些包还没有Python3.9的轮子文件，所以您可能需要编译它们。一般来说，最好使用更具体的标记，因为

  python:3-slim

  标记将在不同的时间点指向不同版本的python

您还可以省略

gfortran

、

libopenblas dev

和

liblapack dev

的安装。这些软件包对于构建numpy/scipy是必需的，但是如果安装了预编译的wheel文件，则不需要编译任何代码

使用

pip install

中的

--no cache dir

禁用缓存。如果不包括此项，则pip的缓存将计入Docker映像大小

mysqlclient的

没有linux控制盘，因此您必须编译它。您可以在一条
运行
指令中安装生成依赖项，安装软件包，然后删除生成依赖项。请记住，
libmariadb3
是此包的运行时依赖项

下面是实现上述建议的Dockerfile。它使Docker映像的大小达到354MB

FROM python:3.8-slim

# Install mysqlclient (must be compiled).
RUN apt-get update -qq \
    && apt-get install --no-install-recommends --yes \
        build-essential \
        default-libmysqlclient-dev \
        # Necessary for mysqlclient runtime. Do not remove.
        libmariadb3 \
    && rm -rf /var/lib/apt/lists/* \
    && python3 -m pip install --no-cache-dir mysqlclient \
    && apt-get autoremove --purge --yes \
        build-essential \
        default-libmysqlclient-dev

# Install packages that do not require compilation.
RUN python3 -m pip install --no-cache-dir \
      numpy scipy pandas matplotlib

---

使用alpine linux是个好主意，但alpine使用muslc而不是glibc，因此它与大多数pip控制盘不兼容。结果是您必须编译numpy/scipy。

您确定吗？我刚才试过两次使用该映像，但是

pip install mysqlclient

导致

OSError:mysql\u config not found

，而numpy导致

RuntimeError:breaked toolchain:无法链接简单的C程序

似乎mysqlclient就是问题所在。我不认为numpy有这个问题。。。我不认为您在复制我的答案中的dockerfile。对，我使用了第一个版本的python:3-slim代码，并且包已成功安装在3.8版本上。除了

mysqlclient

：（谢谢！您的最终Dockerfile运行良好，结果是480MB，比我的原始版本小3倍多嗨！您确定在安装python mysqlclient后删除系统的mysqlclient吗？它似乎工作正常：

NameError:name'\u mysql'未定义

。查看更多信息。您确定吗？我尝试了两次使用该映像刚才，但是

pip安装mysqlclient

导致了

OSError:mysql\u config not found

，而numpy导致了

RuntimeError:breaked toolchain:cannotlink a simple C program

似乎是mysqlclient的问题。我看不出numpy的问题……我不认为你在我的回答中复制了dockerfile。对，我使用了fi使用

python:3-slim

的代码的rst版本，并且包已成功安装在3.8版本上。除了

mysqlclient

：（谢谢！您的最终Dockerfile运行良好，结果是480MB，比我的原始版本小3倍多。您好！您确定在安装python mysqlclient后删除系统的mysqlclient吗？它似乎工作正常：

NameError:name'\u mysq