Python 未找到包：*.pxd文件的Cython C级接口

简而言之

我尝试编译一个名为

extension2

的cython扩展名，它从一个自建包中导入一个文件

扩展名

。在构建

extension2

时，我得到一个错误，即未找到

extension.pxd

，尽管该文件正好位于指定的路径

详细信息

我正在构建两个涉及cython的包，一个包

a

和一个包

B

，这取决于

a

A

是名称空间包

nsp

的子包。也就是说，文件夹结构如下所示：

├── nsp
│   └── A
|       ├── extension.pxd
|       ├── extension.pyx
│       └── __init__.py
└── setup.py

from setuptools import setup
from setuptools.extension import Extension

# factory function
def my_build_ext(pars):
    # import delayed:
    from setuptools.command.build_ext import build_ext as _build_ext

    # include_dirs adjusted: 
    class build_ext(_build_ext):
        def finalize_options(self):
            _build_ext.finalize_options(self)
            # Prevent numpy from thinking it is still in its setup process:
            __builtins__.__NUMPY_SETUP__ = False
            import numpy
            self.include_dirs.append(numpy.get_include())

    #object returned:
    return build_ext(pars)

extensions = [Extension(nsp.A.extension, ['nsp/A/extension.cpp'])]

setup(
    cmdclass={'build_ext' : my_build_ext},
    setup_requires=['numpy'],
    install_requires=['numpy'], 
    packages=['nsp.A'],
    ext_modules=extensions
    package_data={
        'nsp/A': ['*.pxd', '*.pyx']
    },
)

├── nsp
│   ├── __init__.pxd
│   └── A
|       ├── extension.pxd
|       ├── extension.pyx
│       └── __init__.py
└── setup.py

此处，

setup.py

内容如下：

├── nsp
│   └── A
|       ├── extension.pxd
|       ├── extension.pyx
│       └── __init__.py
└── setup.py

from setuptools import setup
from setuptools.extension import Extension

# factory function
def my_build_ext(pars):
    # import delayed:
    from setuptools.command.build_ext import build_ext as _build_ext

    # include_dirs adjusted: 
    class build_ext(_build_ext):
        def finalize_options(self):
            _build_ext.finalize_options(self)
            # Prevent numpy from thinking it is still in its setup process:
            __builtins__.__NUMPY_SETUP__ = False
            import numpy
            self.include_dirs.append(numpy.get_include())

    #object returned:
    return build_ext(pars)

extensions = [Extension(nsp.A.extension, ['nsp/A/extension.cpp'])]

setup(
    cmdclass={'build_ext' : my_build_ext},
    setup_requires=['numpy'],
    install_requires=['numpy'], 
    packages=['nsp.A'],
    ext_modules=extensions
    package_data={
        'nsp/A': ['*.pxd', '*.pyx']
    },
)

├── nsp
│   ├── __init__.pxd
│   └── A
|       ├── extension.pxd
|       ├── extension.pyx
│       └── __init__.py
└── setup.py

设置文件的灵感来自和。cython文件已使用另一个脚本成功转换为

.cpp

文件

我使用安装包

A

pip install .

在

setup.py

目录中。一切正常，我可以在

..\Anaconda3\Lib\site packages\nsp\A

下找到包的所有文件，包括

*.pxd

文件

现在，我试图为

扩展2

创建一个

*.cpp

文件，以便稍后在第二个包

B

中对其进行打包。文件

extension2.pxd

读取

from nsp.A.extension cimport mymethod

创建

*.cpp

文件的脚本如下

from distutils.core import setup, Extension
from Cython.Build import cythonize
import numpy as np
import sys
print(sys.executable)

NAME = 'extension2'
extensions = [Extension(NAME, [NAME+'.pyx'],
                        include_dirs=[np.get_include()]
                        )
              ]

setup(name=NAME,
      ext_modules = cythonize(extensions, language="c++", 
                              compiler_directives=compiler_directives),
      include_dirs=[np.get_include()]
      ) 

当我使用

python myscript build\u ext--inplace

运行此脚本时，我收到一个错误，指示缺少

pxd

文件：

from nsp.A.extension cimport mymethod
^
------------------------------------------------------------

.\extension2.pxd:11:0: 'nsp\A\extension.pxd' not found

但是，该文件确实存在于该位置。（

sys.executable

是包含已安装软件包的

Anaconda3

文件夹）如何解决此问题

其他信息

我正在Windows x64上使用python 3.7，Cython目前还不支持。也就是说，cython只搜索包含文件

init.*

的子目录，其中

*

可以是

py

、

pyc

、

pyx

和

pxd

中的任何内容

我已经创建了一个，以防您希望跟进问题是否已在更新版本中得到修复（我使用Cython 0.29.14）

在此之前，一种解决方法是在文件夹

nsp

中创建一个空文件

\uuu init\uuuu.pxd

。python应该忽略此文件，因为它不是

*.py

文件，并允许cython在子目录中搜索包。文件结构如下所示：

├── nsp
│   └── A
|       ├── extension.pxd
|       ├── extension.pyx
│       └── __init__.py
└── setup.py

from setuptools import setup
from setuptools.extension import Extension

# factory function
def my_build_ext(pars):
    # import delayed:
    from setuptools.command.build_ext import build_ext as _build_ext

    # include_dirs adjusted: 
    class build_ext(_build_ext):
        def finalize_options(self):
            _build_ext.finalize_options(self)
            # Prevent numpy from thinking it is still in its setup process:
            __builtins__.__NUMPY_SETUP__ = False
            import numpy
            self.include_dirs.append(numpy.get_include())

    #object returned:
    return build_ext(pars)

extensions = [Extension(nsp.A.extension, ['nsp/A/extension.cpp'])]

setup(
    cmdclass={'build_ext' : my_build_ext},
    setup_requires=['numpy'],
    install_requires=['numpy'], 
    packages=['nsp.A'],
    ext_modules=extensions
    package_data={
        'nsp/A': ['*.pxd', '*.pyx']
    },
)

├── nsp
│   ├── __init__.pxd
│   └── A
|       ├── extension.pxd
|       ├── extension.pyx
│       └── __init__.py
└── setup.py

要在名称空间包中安装附加文件

\uuuu init\uuuuuuuu.pxd

，请将

setup（…）

的

packages

参数更改为

packages=['nsp'，nsp.A']

，并将

package\u data

参数更改为

package\u data={'：['*.pxd'，'*.pyx']}

编辑：

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cython开发人员已经知道这个bug，并将在版本3中修复。请参阅。

您确定pip是正确的pip吗？也就是说，pip用于python3.7而不是Python2？否则，请在安装程序中检查python路径。py@ead我确信我使用的是正确的Python安装。我只有一次安装，导入编译文件（不是pxd）效果很好。出于同样的原因，我相信setup.py中的路径是正确的。