如何从python输出创建表

我已经编写了一个python程序，其中我在目录中存储了各种文件。这些文件有n个字符

代码读取这些文件并打印

文件名

文件长度

文件中某些字符的文本模式

我得到了以下输出：

36.HomoSapiensHOXD10gene.fa ....... this is the file name
11753.................length of the file for characters
([2296, 2304, 5794, 10258, 11272],)................patterns of text 

37.HomoSapiensHOXD11gene.fa
6139
([],)

38.HomoSapiensHOXD13gene.fa
3648
([403, 2718],)

我想以表格形式显示上述输出，如下所示

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请帮助

假设您的O/p如下所示：

36.HomoSapiensHOXD10gene.fa 11753 ([2296, 2304, 5794, 10258, 11272],)
37.HomoSapiensHOXD11gene.fa 6139 ([],)
38.HomoSapiensHOXD13gene.fa 3648 ([403, 2718],)

首先在终端上运行你的程序

python yourfile.py > yourfile.txt

这将把输出复制到yourfile.txt 然后使用以下python代码将其转换为整洁的表格格式：

import pandas as pd
file_data = open('yourfile.txt', 'r').read().splitlines()  # Read your file
data = pd.DataFrame(columns=['file', 'length', 'pattern'])
file = []  # filennames
le = []  #length of file
pattern = []  # patterns
for f in file_data:
    s = f.split(" ", 2) #Two times split on space to get a list of all three parameters
    file_name = s[0].split('.', 1)[1] #extracting just the file name ignoring numbers
    length = s[1]
    patt = s[2].replace('(', '').replace('[', '').replace(']', '').replace(')', '')  # Removing useless brackets
    try:
        pattern.append(patt.rsplit(',', 1)[0])  # Removing the comma at the end
    except:
        pattern.append('no pattern')
    file.append(file_name)
    le.append(length)
data['file'] = file
data['length'] = le
data['pattern'] = pattern
print(data)

现在，如果这是您想要的，您将获得所需的输出。您还可以使用pandas将其保存为excel/csv格式

                       file length                         pattern
0  HomoSapiensHOXD10gene.fa  11753  2296, 2304, 5794, 10258, 11272
1  HomoSapiensHOXD11gene.fa   6139                                
2  HomoSapiensHOXD13gene.fa   3648                       403, 2718

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请把这个和prettytable一起试试

from prettytable import PrettyTable

x = PrettyTable()
x.field_names = ["Field Name", "Length", "Pattern"]
x.add_row(["HOXD10gene.fa", 11753, [2296, 2304, 5794, 10258, 11272]])
print(x)

您可以尝试从csv文件导入数据，如下所示

from prettytable import from_csv
with open("data.csv", "r") as fp: 
x = from_csv(fp)
print(x)

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你好，到目前为止你试过什么？你能给我看一些代码并告诉我你在哪里卡住了吗？我没有卡住，但是我想不出一种方法来将上面的输出转换成表格格式。你需要用文本字符在控制台中显示它吗？您是否考虑过用表生成HTML文件？谢谢代码。但在执行相同的操作后，我得到一个错误消息文件名行位置回溯2 FileNotFoundError:[Errno 2]没有这样的文件或目录：“hoxgenewithpromotors.txt”。我需要将此文件放置在何处，我的意思是python安装在该目录的何处。我现在可以在将文件放置在写入目录后获取该文件，但获取未找到索引错误文件_name=s[0]。拆分（“，”，1）[1]#仅提取文件名忽略数字这意味着您可能有任何空行，或在其上拆分的不带空格的行。我建议您删除空行或使用try-except语句。谢谢，我尝试了它，但长度为空。可能您的控制台收缩了输出，因为我首先在我的系统上测试了上面的代码。如果您还没有找到解决方案，请检查提供的格式是否正确，或者发布输出。我无法导入PrettyTables。或者从pip安装了相同的PrettyTables，它工作得很好，谢谢tonI。我有一个问题。我已经将输出复制到文本文件中，然后在代码中分别添加了行。我多次添加了x.add_行。如何通过直接从文本文件中读取这些行来循环这些行。请建议您最好从csv文件导入数据。我已经更新了帖子