Python 将地物对象添加到AxesSubplot Gridspec

我正在使用Biopython的

Phylo

模块生成一棵树，并进一步使用

gcf

将当前树保存为

matplotlib

的图形对象

tree = Phylo.read("my tree.nwk", "newick")  
Phylo.draw(tree)
tree_f=plt.gcf()

我希望能够在子地块中使用此地物对象：

gs = gridspec.GridSpec(1, 2, height_ratios=[1, 1, -2, 2],
                             width_ratios=[1, 1, -2, 2], hspace=0, wspace=0) 
phyl_ax = plt.subplot(gs[0])
ht_ax = plt.subplot(gs[1])

如何使phyl_ax占据一个地物对象

我尝试了

phyl\u ax（tree\u f）

，但失败的原因是：

TypeError:“AxeSubPlot”对象不可调用

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我没有使用Phylo，但从中可以看出，您只需要将轴设置为关键字：

phyl_ax=plt.subplot(gs[0])   
Phylo.draw(tree, axes=phyl_ax)

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试过这个。它说：TypeError:draw（）得到了一个意外的关键字参数'axes'draw需要一个“matplotlib.axes.axes”对象，因为我使用的是gridspec phyl_ax，所以它是一个“matplotlib.axes.AxesSubplot”对象。我是否正确地假设这是导致它产生错误的原因？还有什么办法吗？别这么想。如果执行

isinstance（phyl\u ax，matplotlib.axes.axes）

？您使用的是Phylo的最新版本吗？升级BioPython有帮助。