Python 如何在scikitlearn中对特征子集应用多项式变换

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Scikitlearn有助于多项式特征生成

下面是一个简单的例子:

import numpy as np
import pandas as pd
from sklearn.preprocessing import PolynomialFeatures

# Example data:
X = np.arange(6).reshape(3, 2)


# Works fine
poly = PolynomialFeatures(2)
pd.DataFrame(poly.fit_transform(X))

   0  1  2   3   4   5
0  1  0  1   0   0   1
1  1  2  3   4   6   9
2  1  4  5  16  20  25
问题:是否有能力仅将多项式变换应用于指定的特征列表

e、 g

当使用该特性来组合一系列的特性生成和模型训练代码时,这将特别有用

一种选择是由Michelle Fullwood推出您自己的transformer,但我认为其他人以前可能会偶然发现这个用例。

和sklearn中的许多其他transformer一样,并没有指定要应用哪些数据列的参数,因此,将其投入管道并期望其发挥作用并非易事

更一般的方法是,您可以使用另一个管道为数据帧中的每个功能使用和指定转换器

一个简单的例子是:

从sklearn.pipeline导入功能联合 从sklearn.preprocessing导入多项式特征、OneHotEncoder、LabelEncoder 从sklearn.linear_模型导入逻辑回归 从sklearn.pipeline导入管道 数据帧{'cat_var':['a','b','c'],'num_var':[1,2,3]} 类ColumnExtractorobject: def _init__self,列=无: self.columns=列 def fitself,X,y=无: 回归自我 def transformself,X: X_cols=X[self.columns] 返回X_cols 管道=管道[ “特色”,特色联盟[ “num_var”,管道[ “extract”,ColumnExtractorcolumns=['num_var'], “多边形”,多项式特征梯度=2 ], “cat_var”,管道[ “extract”,ColumnExtractorcolumns=[“cat_var”], “le”,LabelEncoder, “ohe”,一个热编码器, ] ], “估计量”,逻辑回归 ] 是的,有,退房

这应该行得通——应该有一个更优雅的解决方案,但现在无法测试:

from sklearn.preprocessing import PolynomialFeatures
from sklearn_pandas import DataFrameMapper

X2.columns = ['col0', 'col1', 'col2', 'col3', 'col4', 'col5', 'animal']

mapper = DataFrameMapper([
('col0', PolynomialFeatures(2)),
('col1', PolynomialFeatures(2)),
('col2', PolynomialFeatures(2)),
('col3', PolynomialFeatures(2)),
('col4', PolynomialFeatures(2)),
('col5', PolynomialFeatures(2)),
('Animal', None)])

X3 = mapper.fit_transform(X2)

作为对黄彭军回答的回应,该方法非常好,但实施过程中存在问题。 这应该是一个评论,但有点长。还有,没有足够的饼干

我试图使用代码,但遇到了一些问题。在胡闹了一会儿之后,我找到了原来问题的以下答案。 主要问题是ColumnExtractor需要继承BaseEstimator和TransformerMixin,以将其转换为可与其他sklearn工具一起使用的估计器

我的示例数据显示了两个数值变量和一个分类变量。 我使用pd.get_假人进行了一次热编码,以保持管道的畅通 更简单。另外,我省略了管道的最后一个阶段——估计器,因为我们没有y数据来拟合;重点是显示select、单独处理和join

享受

M


对@plumpus_花束代码的改进:

from sklearn.preprocessing import PolynomialFeatures
from sklearn_pandas import DataFrameMapper

X2.columns = ['col0', 'col1', 'col2', 'animal']
degree = 2

mapper = DataFrameMapper(
(['col0', 'col1', 'col2'], PolynomialFeatures(degree))
)

X3 = mapper.fit_transform(X2)
我更喜欢的另一种方法是使用sklearn.compose。我发现它很容易在管道中使用

对于选择列,有多种方法。其中一些方法是:

基于列名 基于数据类型包括和排除选项 索引位置 切片 正则表达式
看。

这太棒了。我接受这个答案是因为它不依赖于额外的图书馆。真的很感谢你,莱昂卡托!在哪里可以指定此代码中应该使用的模型?
import pandas as pd
import numpy as np
from sklearn.pipeline import FeatureUnion
from sklearn.preprocessing import PolynomialFeatures
from sklearn.pipeline import Pipeline
from sklearn.base import BaseEstimator, TransformerMixin

X = pd.DataFrame({'cat': ['a', 'b', 'c'], 'n1': [1, 2, 3], 'n2':[5, 7, 9] })

   cat  n1  n2
0   a   1   5
1   b   2   7
2   c   3   9

# original version had class ColumnExtractor(object)
# estimators need to inherit from these classes to play nicely with others
class ColumnExtractor(BaseEstimator, TransformerMixin):
    def __init__(self, columns=None):
        self.columns = columns
    def fit(self, X, y=None):
        return self
    def transform(self, X):
        X_cols = X[self.columns]
        return X_cols

# Using pandas get dummies to make pipeline a bit simpler by
# avoiding one-hot and label encoder.     
# Build the pipeline from a FeatureUnion that processes 
# numerical and one-hot encoded separately.
# FeatureUnion puts them back together when it's done.
pipe2nvars = Pipeline([
    ('features', FeatureUnion([('num', 
                                Pipeline([('extract', 
                                           ColumnExtractor(columns=['n1', 'n2'])),
                                          ('poly', 
                                           PolynomialFeatures())  ])),
                               ('cat_var', 
                                ColumnExtractor(columns=['cat_b','cat_c']))])
    )])    

# now show it working...
for p in range(1, 4):
    pipe2nvars.set_params(features__num__poly__degree=p)
    res = pipe2nvars.fit_transform(pd.get_dummies(X, drop_first=True))
    print('polynomial degree: {}; shape: {}'.format(p, res.shape))
    print(res)

polynomial degree: 1; shape: (3, 5)
[[1. 1. 5. 0. 0.]
 [1. 2. 7. 1. 0.]
 [1. 3. 9. 0. 1.]]
polynomial degree: 2; shape: (3, 8)
[[ 1.  1.  5.  1.  5. 25.  0.  0.]
 [ 1.  2.  7.  4. 14. 49.  1.  0.]
 [ 1.  3.  9.  9. 27. 81.  0.  1.]]
polynomial degree: 3; shape: (3, 12)
[[  1.   1.   5.   1.   5.  25.   1.   5.  25. 125.   0.   0.]
 [  1.   2.   7.   4.  14.  49.   8.  28.  98. 343.   1.   0.]
 [  1.   3.   9.   9.  27.  81.  27.  81. 243. 729.   0.   1.]]
from sklearn.preprocessing import PolynomialFeatures
from sklearn_pandas import DataFrameMapper

X2.columns = ['col0', 'col1', 'col2', 'animal']
degree = 2

mapper = DataFrameMapper(
(['col0', 'col1', 'col2'], PolynomialFeatures(degree))
)

X3 = mapper.fit_transform(X2)