R 将多个光栅提取编译为一个表
我有3个光栅,其中我使用一条多段线从shapefile中提取数据。目前,我有3个单独的列表提取。是否有一种方法可以从所有三个光栅中提取数据,并将它们编译到一个表中,每个光栅的数据都有不同的列 这是我正在使用的当前代码R 将多个光栅提取编译为一个表,r,r-raster,sp,R,R Raster,Sp,我有3个光栅,其中我使用一条多段线从shapefile中提取数据。目前,我有3个单独的列表提取。是否有一种方法可以从所有三个光栅中提取数据,并将它们编译到一个表中,每个光栅的数据都有不同的列 这是我正在使用的当前代码 Harney_Transects <- readOGR(dsn = ".", layer = "Transect_HN") MeanTreeHeightHarneyBefore=raster('HN_TrMean_B_Clip.tif') ScanAngleHa
Harney_Transects <- readOGR(dsn = ".", layer = "Transect_HN")
MeanTreeHeightHarneyBefore=raster('HN_TrMean_B_Clip.tif')
ScanAngleHarneyBefore= raster('HNScanAngle_B_Clip.tif')
MeanShrubHeightHarneyBefore= raster('HN_MeanShrub_B_Clip.tif')
Extraction_Shrub_Harney= extract(MeanShrubHeightHarneyBefore,Harney_Transects)
Extraction_Tree_Harney= extract(MeanTreeHeightHarneyBefore,Harney_Transects)
Extraction_ScanAngle_Harney= extract(ScanAngleHarneyBefore,Harney_Transects)
Harney_断面简而言之,您可以stack()
所有要从中提取数据的光栅,以及从堆栈中提取数据
这是一个完全可复制的示例,使用了两个光栅和一个SpatialLines
对象,就像您在问题中提到的那样。跳到最后一段代码,直接回答您的问题
library(sp)
library(raster)
# function to generate random rasters
gen_raster <- function(){
r <- raster(nrows = 10, ncols = 10, res = 1,
xmn = 0, xmx = 10, ymn = 0, ymx = 10,
vals = rnorm(100, 5, 1))
return(r)
}
# generate 2 random rasters
r1 <- gen_raster()
r2 <- gen_raster()
# view
par(mfrow = c(1,2))
plot(r1, main = "raster 1"); plot(r2, main = "raster 2")
dev.off()
列的名称是堆栈中光栅图层的名称。您可以使用names(rs)
访问这些名称,并使用names(rs)修改它们。简言之,您可以stack()
所有要从中提取数据的光栅,以及从堆栈中提取
这是一个完全可复制的示例,使用了两个光栅和一个SpatialLines
对象,就像您在问题中提到的那样。跳到最后一段代码,直接回答您的问题
library(sp)
library(raster)
# function to generate random rasters
gen_raster <- function(){
r <- raster(nrows = 10, ncols = 10, res = 1,
xmn = 0, xmx = 10, ymn = 0, ymx = 10,
vals = rnorm(100, 5, 1))
return(r)
}
# generate 2 random rasters
r1 <- gen_raster()
r2 <- gen_raster()
# view
par(mfrow = c(1,2))
plot(r1, main = "raster 1"); plot(r2, main = "raster 2")
dev.off()
列的名称是堆栈中光栅图层的名称。您可以使用名称(rs)
访问这些名称,并使用名称(rs)修改它们。请使您的问题具有可复制性——因此不要参考您的特定文件——请参阅您上一个问题的评论(和我的答案):请使您的问题具有可复制性——因此不要参考您的特定文件——请参阅评论(以及我的回答)对于你之前的问题:所以我遵循了你的示例,但出于某种原因,它将所有内容提取到一个列表中。没错,它应该将内容提取到一个列表中。然后你需要do.call(rbind.data.frame,我的提取列表)
将其转换为data.frame
,将每列作为堆栈中的不同层。请参阅我的示例的第三个代码块。您应该复制/粘贴并运行可复制的示例,以了解其工作原理,然后将其应用于您的代码。问题是,即使我使用do.call函数,它仍然是一个列表,但似乎有只是一个R错误。所以我遵循了您的示例,但出于某种原因,它将所有内容提取到一个列表中。没错,它应该将内容提取到一个列表中。然后您需要do.call(rbind.data.frame,我的\u提取的\u列表)
将其转换为data.frame
,将每列作为堆栈中的不同层。请参阅我的示例的第三个代码块。您应该复制/粘贴并运行可复制的示例,以了解其工作原理,然后将其应用于您的代码。问题是,即使我使用do.call函数,它仍然是一个列表,但似乎有只是一个错误。
rs <- stack(r1, r2) # stack any amount of rasters to extract from
re <- extract(rs, l) # extract at locations `l`
do.call(rbind.data.frame, re) # convert to data.frame
layer.1 layer.2
1 4.586890 5.115136
2 4.780503 5.093281
3 6.877302 3.337345
4 5.913230 3.755099
5 4.907834 4.887160
6 5.576908 5.386136
7 3.572350 5.225392
8 4.778727 5.391765
9 6.600041 4.205841
10 6.946321 5.544172