R install.packages错误:本地回购使用疑难解答

R install.packages错误:本地回购使用疑难解答,r,R,我刚刚创建了一个包(RTIO)和一个包存储库(Q:/integratedplanning/R),这是一个公司网络驱动器 我已将我的包放入文件夹: Q:/integratedplanning/R/bin/windows/contrib/2.15/RTIO_0.1-2.zip 根据Derk在SO中的说明,我运行了以下命令: > setwd("Q:/Integrated Planning/R/bin/windows/contrib/2.15") > tools::write_PACKAGE

我刚刚创建了一个包(
RTIO
)和一个包存储库(
Q:/integratedplanning/R
),这是一个公司网络驱动器

我已将我的包放入文件夹:

Q:/integratedplanning/R/bin/windows/contrib/2.15/RTIO_0.1-2.zip

根据Derk在SO中的说明,我运行了以下命令:

> setwd("Q:/Integrated Planning/R/bin/windows/contrib/2.15")
> tools::write_PACKAGES(".", type="win.binary")
> list.files()
[1] "PACKAGES"       "PACKAGES.gz"    "RTIO_0.1-2.zip"
>
使用下面的代码,我已将本地存储库添加到我的回购列表中(我将让其他用户也这样做):

现在尝试安装我的软件包时,我遇到一个错误:

> install.packages("RTIO")
Installing package(s) into ‘C:/Program Files/R/R-2.15.1/library’
(as ‘lib’ is unspecified)
Warning in install.packages :
  unable to access index for repository Q:/Integrated Planning/R/bin/windows/contrib/2.15
Warning in install.packages :
  unable to access index for repository Q:/Integrated Planning/R/bin/windows/contrib/2.15
Warning in install.packages :
  unable to access index for repository Q:/Integrated Planning/R/bin/windows/contrib/2.15
Warning in install.packages :
  package ‘RTIO’ is not available (for R version 2.15.1)
无法访问存储库的索引告诉我什么?我怎样才能修好它

我真正想做的是,在Windows下,使用RStudio作为IDE,让其他内部R用户添加这个包repo,这样他们就能够运行像
install.packages(“RTIO”)
update.packages()
这样的命令来获得包的新版本(并且可能还能够使用IDE通过GUI管理包)


更新: 多亏了agstudy的回答,我又向前迈进了一步。这是我得到的结果

> getOption("repos")
                                CRAN                            CRANextra 
    "http://cran.ms.unimelb.edu.au/" "http://www.stats.ox.ac.uk/pub/RWin" 
> setRepositories(addURLs=c(RioTintoIronOre = "file://Q:/Integrated Planning/R"))
--- Please select repositories for use in this session ---


1: + CRAN
2: + CRAN (extras)
3:   BioC software
4:   BioC annotation
5:   BioC experiment
6:   BioC extra
7:   Omegahat
8:   R-Forge
9:   rforge.net

Enter one or more numbers separated by spaces, or an empty line to cancel
1: 
> getOption("repos")
                  RioTintoIronOre 
"file://Q:/Integrated Planning/R" 
> install.packages("RTIO")
Installing package(s) into ‘C:/Program Files/R/R-2.15.1/library’
(as ‘lib’ is unspecified)
Warning in install.packages :
  cannot open compressed file '//Q:/Integrated Planning/R/bin/windows/contrib/2.15/PACKAGES', probable reason 'No such file or directory'
Error in install.packages : cannot open the connection
后续问题:
  • 当我使用
    setRepositories()
    时,为什么会提示我选择存储库

  • 当我在没有输入数字的情况下点击“回车”,并选中
    getOption(“repos”)
    时,它只显示
    文件://Q:/integratedplanning/R
    存储库。这是为什么

  • 当我安装.packges(“RTIO”)
  • 时,它似乎找到了该文件,但给出了一个警告
    无法打开压缩文件
    和一个错误
    无法打开连接
    。注意上面
    列表.files()
    的输出。知道为什么吗


    您出现警告“无法访问存储库的索引” 因为
    install.packages
    尝试访问远程存储库中的自定义软件包(无本地)

    要解决此问题,您需要将本地存储库添加到R-options
    repos
    。 您需要将其添加为url路径,而不是文件路径。类似于文件://

    这样做:

          setRepositories(addURLs=c(lRioTintoIronOre = "file://Q:/Integrated Planning/R"))
    
    要检查是否全部正确,必须返回以下值:

        repos <- contrib.url(getOption('repos'))
        length(grep("^file:", repos)) > 0L 
    
    回购0L
    为了避免此消息:

    Warning in install.packages : cannot open compressed file '//Q:/Integrated Planning/R/bin/windows/contrib/2.15/PACKAGES', probable reason 'No such file or directory'
    


    setRepositories
    中指定url时,请尝试此操作以删除
    /

    > setwd("Q:/Integrated Planning/R/bin/windows/contrib/2.15")
    > tools::write_PACKAGES(".", type="win.binary")
    > setRepositories(addURLs=c(RioTintoIronOre = "file:Q:/Integrated Planning/R"))
    > install.packages("RTIO")
    

    抱歉,Tyler,我不明白这个问题有什么关系。这个问题是关于构建程序包的过程,这个问题是关于从本地存储库安装。请注意,我需要通过
    安装。程序包
    -我不希望此程序包的用户使用类似
    devtools
    的任何东西。我误解了问题。我删除了评论。我很确定你应该在
    Q:/Integrated Planning/R
    中找到
    ,而不是windows特定目录。嘿,伙计,非常感谢你的回答。这似乎让我更接近了,但现在遇到了一些其他问题。我已经用详细信息更新了我的问题。
    seTrepositions
    不会在会话之间保持不变,因此我已更改了我的
    r配置文件.site
    以永久添加本地repo。(在文件本身中找到了有关如何执行此操作的说明)。现在,当我键入
    getOption(“repo”)时
    在一个新的会话中,除了CRAN和CraneExtra之外,它还向我显示了本地回购协议。也就是说,我仍然会遇到错误,但至少现在是不同的错误。
    > setwd("Q:/Integrated Planning/R/bin/windows/contrib/2.15")
    > tools::write_PACKAGES(".", type="win.binary")
    > setRepositories(addURLs=c(RioTintoIronOre = "file:Q:/Integrated Planning/R"))
    > install.packages("RTIO")