R 错误:必须从色调调色板请求至少一种颜色
我有一些数据如下所示:R 错误:必须从色调调色板请求至少一种颜色,r,ggplot2,R,Ggplot2,我有一些数据如下所示: <int> hgnc_symbol <fctr> structure <int> Promedio_senal <dbl> >8903 MECP2 10225 7.006842 >3216 CDKL5 10225 7.484454 >1405 AUTS2 10225 12.801426 >4254 DAPK1 10225
<int> hgnc_symbol
<fctr> structure
<int> Promedio_senal
<dbl>
>8903 MECP2 10225 7.006842
>3216 CDKL5 10225 7.484454
>1405 AUTS2 10225 12.801426
>4254 DAPK1 10225 6.171004
>12160 RBFOX1 10225 30.756440
>8903 MECP2 10185 6.595135
>3216 CDKL5 10185 6.067631
>1405 AUTS2 10185 11.053545
>4254 DAPK1 10185 6.222515
>12160 RBFOX1 10185 25.431652
我想做一个条形图,x轴上是基因的名称(hgnc_符号),y轴上是基因表达(Promedio_senal)
我有两个不同大脑结构的数据,我想用不同的颜色并排显示这两个结构的条形图。我使用的代码如下所示:
G_OBJ[, structure:=factor(structure, levels = 1:2, labels = c("10225", "10185"))]
ggplot(G_OBJ, aes(hgnc_symbol, Promedio_senal)) +
geom_col(aes(fill=structure), position = "dodge")+
scale_x_discrete("GEN") +
scale_y_continuous("EXPRESION") +
labs(title = "GENES_OBJETIVO")
但当我运行此命令时,会出现以下错误消息:
错误:必须从色调调色板请求至少一种颜色
我相信错误在于我尝试使用结构作为填充颜色的部分,但我不确定;即使是这样,我也不知道要改变什么才能使它正确
我非常感谢您的帮助这里有一种方法,在您定义美学参数时直接使用
geom_bar
并将structure
as.character(而不是将其转换为factor)
library(tidyverse)
G_OBJ %>%
ggplot(aes(x = hgnc_symbol,
y = Promedio_senal,
fill = as.character (structure))) +
geom_bar(stat = "identity", position = position_dodge())+
scale_x_discrete("GEN") +
scale_y_continuous("EXPRESION") +
labs(title = "GENES_OBJETIVO") +
scale_fill_discrete(name = "structure")
您能否将数据样本作为
dput
共享,以提高再现性?使用dput(头部(df,n))
。
library(tidyverse)
G_OBJ %>%
ggplot(aes(x = hgnc_symbol,
y = Promedio_senal,
fill = as.character (structure))) +
geom_bar(stat = "identity", position = position_dodge())+
scale_x_discrete("GEN") +
scale_y_continuous("EXPRESION") +
labs(title = "GENES_OBJETIVO") +
scale_fill_discrete(name = "structure")