R 使用getGEO下载GPL文件时出错

使用OSX 10.11和R 3.3.0，我在使用GEOQuery软件包时遇到此错误：

library(GEOquery)
GSE56045 <- getGEO("GSE56045")

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看起来GPL文件被重定向，GEOquery中自动设置的下载方法无法遵循重定向：

设置选项（'download.file.method.GEOquery'='auto'）

通过在R:

options（'download.file.method.GEOquery'='libcurl'）中运行此命令，我可以让它正常工作。

此外，我还必须删除旧的下载的GPL文件-这只是重定向消息。使用getGEO命令的

destdir=

设置下载目录而不是查找临时文件更容易

Error in download.file(myurl, destfile, mode = mode, quiet = TRUE, method = getOption("download.file.method.GEOquery")) : 
  cannot open URL 'http://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?targ=self&acc=GPL10558&form=text&view=full'