R CMD build与devtools:：build（）（在顶层找到非标准文件/目录）

我正在编写一个R包，并使用以下工具进行构建和测试：

Rscript -e "devtools::document()" && R CMD build . && Rscript -e "devtools::test();devtools::check()"

我收到一张便条：

checking top-level files
   Non-standard file/directory found at top level:
     ‘PosteriorBootstrap_0.0.1.tar.gz’

我知道

devtools:：check（）

是第一位还是第二位

建议：

便条告诉您通常不应该有一个名为 在包的顶层构建

tar.gz

文件是由

R CMD build

创建的，即使在运行它之前删除它，我也会收到相同的错误

建议将

tar.gz

文件添加到

.Rbuildinore

，从而删除注释

另一种删除它的方法是从devtools运行所有内容：

Rscript -e "devtools::document(); devtools::build(); devtools::load_all('.'); devtools::test(); devtools::check()"

然后我就没有收到那张纸条

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R CMD build

和

devtools:：build（）

之间有什么区别？为什么前者会引起这样的注意？

您正在组合许多执行类似和/或竞争功能的步骤。我建议阅读《最佳实践

构建

和

检查

工作流》

当您运行

R CMD build

时，它会将包构建到当前目录，即顶级包目录。因此，当您运行检查时，它会在包根目录中看到.tar.gz文件，这是包中的非标准文件，因此会发出警告

devtools:：build（）

是智能的，它将包构建到包父目录中（无论从何处调用）。尝试调用与

devtools

函数混合使用的

R CMD

命令可能会产生问题，因为

devtools

也会调用

R CMD

命令，因此您可能会在不同的时间点重复操作，或者导致以不正确的顺序调用命令

根据上面的链接，最佳实践工作流将是：

Rscript -e "devtools::document();devtools::check();devtools::build()"

从包根目录调用，可以完全避免处理

R CMD

。如果您想使用

R CMD

，它将如下所示：

Rscript -e "devtools::document()" && cd .. && R CMD build PosteriorBootstrap && R CMD check PosteriorBootstrap*.tar.gz

从包根目录开始，然后更改为父目录