使read.csv不将单个空格视为R中的除味器

我有很多数据帧，有时看起来像这样：

EC number   hits    family distribution
3.2.1.x 3   3 CBM32
3.2.1.1 2   2 CBM41
3.2.1.4 2   2 CBM3
2.4.1.18    1   1 CBM48
3.2.1.14    4   1 CBM2  1 CBM5  2 CBM16
3.2.1.39    4   3 CBM13 1 CBM32
3.2.1.50    1   1 CBM32
3.2.1.55    1   1 CBM13
3.2.1.68    2   2 CBM48

对于最后一列，有时有多个条目通过空格分隔

我用这个来读入R：

test=read.csv("path/to/summary.txt", header = TRUE, sep = "\t")

但我得到以下输出：

    EC.number  hits family.distribution
1   3.2.1.x 3   3 CBM32
2   3.2.1.1 2   2 CBM41
3   3.2.1.4 2   2 CBM3
4   2.4.1.18    1   1 CBM48
5   3.2.1.14    4   1 CBM2
6   1 CBM5  2 CBM16 
7   3.2.1.39    4   3 CBM13
8   1 CBM32     
9   3.2.1.50    1   1 CBM32
10  3.2.1.55    1   1 CBM13
11  3.2.1.68    2   2 CBM48

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我怎样才能避开这件事？我想我已经解释了我的问题，但如果我没有解释，请随时询问更多信息：）

您可以尝试将数据读取为字符串，然后修改它（例如使用

gsub

将所有选项卡替换为单个空格），然后将其读取为数据。框架：

# Read the csv as text, so we can run it through gsub
#
file_connection <- file("path_to_csv.csv")
text <- readLines(file_connection)
close(file_connection)

然后我们用逗号替换一个或多个后续空格或制表符

sanitized <- gsub("[ \t]+", ",", santized_names)    

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数据框不能为一列的每行保存多个条目。也许你可以逐行阅读并创建一个列表（）。我想不出一个简单的单行解决方案。@JAQuent有一种方法可以使它要么把最后一列拼凑在一起，要么忽略它。最后我尝试了[，1:2]，但结果还是一样。@G.Grothendieck，只有在我能够读入数据的情况下才有效。

sanitized <- gsub("[ \t]+", ",", santized_names)    

sanitized <- paste0(sanitized, collapse="\n")

df <- read.csv(text=sanitized)