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用R对非数值数据集进行叠加

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用R对非数值数据集进行叠加,r,stack,R,Stack,我有一个需要堆叠的GO术语的data.frame。 df看起来像： > head(GO_info) V2 Gene1 GO:0003674,GO:0005215,GO:0005216,GO:0005575 Gene2 GO:0000462,GO:0002181,GO:0003674,GO:0003735 但我希望这个数据帧堆叠起来，包括标题“ind”和“value”，如： 我尝试使用： GO_info2 <- stack(GO_info) GO_info2 数据 d

我有一个需要堆叠的GO术语的data.frame。 df看起来像：

> head(GO_info)
      V2 
Gene1 GO:0003674,GO:0005215,GO:0005216,GO:0005575
Gene2 GO:0000462,GO:0002181,GO:0003674,GO:0003735
但我希望这个数据帧堆叠起来，包括标题“ind”和“value”，如：

我尝试使用：

GO_info2 <- stack(GO_info)

GO_info2
数据

dft感谢您的评论，但它似乎还不起作用。我试着实现它：
GOterm%separate（V2，into=c（'ind'，'values'），sep='\\s'）%%>%GOterm=new stacked datafile和GO_info我的旧df和1000个基因ID。我得到以下警告：警告消息：预计2件。在24140行[1,2,3,4,5,6,7,8,9,10,11,12,13,14,15,16,17,18,19,20，…]中填入
NA`的缺失片段。它只是将我的基因名（如“TRINITY_DN100009_c0_g1”）替换为值1,2,3,4。我在>中看到（GO_info）是一个小错误。列1有一个名为V1的标题，所以它看起来像：V1 V2 Gene1 GO:0003674，GO:0005215，GO:0005216，GO:0005575 Gene2 GO:000462，GO:0002181，GO:0003674，GO:0003735，因为a的代码不起作用。Suliman现在我按如下方式尝试：
GOterm如果有两列V1和V2，那么您可以执行
df%>%分隔的行（V2，sep=，'））
。然后使用
colnames（df）更改列名称

GO_info2 <- stack(GO_info)



 library(tidyr)
 df %>% separate(V2,into = c('ind','values'),sep = '\\s') %>%  #separate V2 to inds and values at space \\s
        separate_rows(values,sep = ',')                        #separate values to multiple rows at ','

      ind     values
  1 Gene1 GO:0003674
  2 Gene1 GO:0005215
  3 Gene1 GO:0005216
  4 Gene1 GO:0005575
  5 Gene2 GO:0000462
  6 Gene2 GO:0002181
  7 Gene2 GO:0003674
  8 Gene2 GO:0003735



 df<-read.table(text="
           V2 
           'Gene1 GO:0003674,GO:0005215,GO:0005216,GO:0005575'
           'Gene2 GO:0000462,GO:0002181,GO:0003674,GO:0003735'
           ",header=TRUE)