在OSX中使用crontab每天运行R脚本_R_Macos_Cron_Crontab

在OSX中使用crontab每天运行R脚本

r macos cron

在OSX中使用crontab每天运行R脚本,r,macos,cron,crontab,R,Macos,Cron,Crontab,我想设置一个crontab，在周一到周五的下午5点运行emailSender.R脚本。 emailSender.R的脚本如下所示： library(rmarkdown) rmarkdown::render("htmlmarkdown.Rmd") library(gmailR) gmailR::gmail( to =c("recipient@email.com"), subject = "Subject", message = "Message", username = "m

我想设置一个crontab，在周一到周五的下午5点运行emailSender.R脚本。

emailSender.R的脚本如下所示：

library(rmarkdown)

rmarkdown::render("htmlmarkdown.Rmd")


library(gmailR)
gmailR::gmail(
  to =c("recipient@email.com"),
  subject = "Subject",
  message = "Message",
  username = "me@email.com",
  password = "password",
  attachment = "htmlmarkdown.html"
)

然后我打开终端，通过首先键入crontab-e来设置crontab

然后弹出一个窗口，我尝试使用以下代码设置cronjob

0 17 * * * Rscript /Users/username/emailSender.R

不幸的是，emailSender.R没有按计划运行

如果能得到crontab的帮助来安排我的R脚本，我将不胜感激

编辑：返回终端并键入Rscript后，系统会提示：

-bash: Rscript: command not found

也许在cron设置任务之前，我必须在路径中设置Rscript。尽管进行了广泛的搜索，但仍不确定如何做到这一点

尝试安装cronR包

完成此操作后，您应该能够导航到工具>加载项，在那里可以执行包。它将启动一个计划程序，允许您计划脚本运行的时间

如果您有权限问题，请转到系统首选项>安全性>隐私。单击“完全磁盘访问”并授予RStudio/R访问权限。这将允许您计划将来运行的作业。

尝试安装cronR包

完成此操作后，您应该能够导航到工具>加载项，在那里可以执行包。它将启动一个计划程序，允许您计划脚本运行的时间

如果您有权限问题，请转到系统首选项>安全性>隐私。单击“完全磁盘访问”并授予RStudio/R访问权限。这将允许您计划将来运行的作业。

您需要包括Rscript的路径：

0 17 * * * /usr/local/bin/Rscript /Users/username/emailSender.R

您需要包括Rscript的路径：

0 17 * * * /usr/local/bin/Rscript /Users/username/emailSender.R

就我个人而言，我使用crongui（在Linux上称为调度任务）来设置我的cron作业，并让它运行

bash r\u script\u runner.sh

。那个文件只有

#/第一行的bin/bash

和

path/to/r\u script.r

。这很好。谢谢，我尝试在OSX上使用cronnix GUI，但也无法使其正常工作。按Escape退出插入模式，然后键入

：wq

写入并退出。在终端中键入

哪个Rscript

，找到它的安装位置，然后在

crontab

中使用完整路径，而不是普通的

Rscript

。如果您希望使用图形编辑器编辑crontab，请在运行

crontab-e

之前执行此操作

export EDITOR=/Applications/TextEdit.app/Contents/MacOS/TextEdit

就我个人而言，我使用cron GUI（在Linux上称为调度任务）来设置我的cron作业，并让它运行

bash r\u script\u runner.sh