R 儿童不'；无法从子目录连接到父文件

我想用R和Latex代码在Rstudio中创建一个可复制的研究文件。 我有父文件和两个子文件.Rnw。我的文件夹组织如下所示：

+--project_folder
   +--data.csv
   +-- parent_folder
       +-- parent.Rnw
       +-- child1_folder
           +-- child1.Rnw
       +-- child2_folder
           +-- child2.Rnw

这是会话信息：

R version 3.3.1 (2016-06-21)
Running under: OS X 10.12.1 (Sierra)

parent.Rnw
在父文件夹中，我加载所有包，导入数据库并进行一些预处理，然后将数据分析导航到两个独立的子文件夹

<blink>
\documentclass[10pt]{article}

\begin{document}

<<import-preprocess-data, echo=TRUE, eval=TRUE, error=TRUE, warning=TRUE, cache=FALSE>>=
#import data, packages and functions
library(rsubgroup)
library(SDEFSR)
library(xtable)
library(knitr)
library(ggplot2)

source("./supplement_function/VRE_e.faecium_func.R", chdir = TRUE)
source("./supplement_function/rule-subdataset.R", chdir = TRUE)
source("./supplement_function/confusion-matrix.R", chdir = TRUE)
source("./supplement_function/preprocess-database.R", chdir = TRUE)
source("./supplement_function/result-summary.R", chdir = TRUE)

file_path <- "../data.csv"

database <- read.table(file = file_path, header = TRUE, sep = ";")

#preprocess data
database <- preprocess_data(dataset = database)

#extract data for Enteroccocus faecium
data_E_faecium <- database[database$MICROORGANISM == "ENTEROCOCCUS FAECIUM", ]

<<rsubgroup-child, child="./subgroup_child/rsubgroup-analysis.Rnw", eval=TRUE>>=
@

\end{document}

<\blink>

\documentclass[10pt]{article}
\开始{document}
=
#导入数据、包和函数
图书馆（分组）
图书馆（SDEFSR）
图书馆（xtable）
图书馆（knitr）
图书馆（GG2）
来源（“./补充功能/VRE\u e.faecium\u func.R”，chdir=TRUE）
源（“./补充函数/规则子数据集.R”，chdir=TRUE）
来源（“./补充函数/混淆矩阵.R”，chdir=TRUE）
source（“./补充函数/preprocess database.R”，chdir=TRUE）
来源（“./supplement\u function/result summary.R”，chdir=TRUE）
文件路径直接编织孩子Rnw的动机是什么？当你在分析中做一些更改时，你不必编织所有文件来查看结果，你只需编织孩子即可。我正在积极地处理项目和更改代码，我不想每次在R代码中做一些小的更改时都编织所有东西。在这种情况下，我建议使用knitr的--可以使用knitr的，以便只重新呈现修改过的块。谢谢。但我认为这并不能解决为什么我不能编织独子文件的问题。我想解决的问题是，将孩子连接到我可以将孩子编织成独立文件的家长。我不确定这是否可行。除了缓存之外，我采取的另一种方法是分解子模块，使其变小和模块化，然后创建轻量级父文档，根据分析目标导入子文件的不同子集。例如，您可以从父项（库导入、设置等）提取所需的关键部分，然后将其复制并粘贴到一个新文档中，从而编织子项。同样，这不是你想要做的，但它可能是最好的选择。直接编织孩子Rnw的动机是什么？当你在分析中做一些更改时，你不必编织所有文件来查看乳胶的结果，你只是编织孩子。我正在积极地处理项目和更改代码，我不想每次在R代码中做一些小的更改时都编织所有东西。在这种情况下，我建议使用knitr的--可以使用knitr的，以便只重新呈现修改过的块。谢谢。但我认为这并不能解决为什么我不能编织独子文件的问题。我想解决的问题是，将孩子连接到我可以将孩子编织成独立文件的家长。我不确定这是否可行。除了缓存之外，我采取的另一种方法是分解子模块，使其变小和模块化，然后创建轻量级父文档，根据分析目标导入子文件的不同子集。例如，您可以从父项（库导入、设置等）提取所需的关键部分，然后将其复制并粘贴到一个新文档中，从而编织子项。再说一次，这不是你想要做的，但它可能是最好的选择。
<<rsubgroup-to-parent, echo=FALSE, cache=FALSE>>=
#connect with parent file
set_parent('../report.Rnw')
@