R ggplot：使用用户值的条的颜色渐变

我正在使用ggplot绘制以下数据帧的gene和logFC列： 为了简单起见，我省略了一些行

gene       variable        logFC       logP
CS, gltA    25:1 vs 5:1   -1.6443477   11.3492020
ACO, acnA   25:1 vs 5:1   -1.4393181   8.1938808
IDH3        25:1 vs 5:1   -1.6374355   5.0329107
LSC1        25:1 vs 5:1    0.6577531   0.5235756
CS, gltA    250:1 vs 5:1  -1.0587372   1.3417342
ACO, acnA   250:1 vs 5:1  -0.4354191   7.1746206
IDH3        250:1 vs 5:1  -0.9513132   5.6105933
LSC1        250:1 vs 5:1  -0.3871476   3.9403641

这是我的代码：

ggplot(tca_m, aes(gene,logFC))
last_plot()+geom_bar(aes(fill=tca_m$variable),width = 0.5, stat="identity",position = "dodge") 
last_plot()+ coord_flip()

这给了我以下的情节：

现在，我想使用基于logP列值的颜色渐变来更改条的颜色，并在variable列下为两个不同的变量使用不同的颜色方案。这是否可能使用ggplot？

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谢谢

在

ggplot

中，对于

美学

而言，我们不能有两种不同的尺度。但是，我们可以使用

scale\u fill\u diller

和

facet\u wrap

构建一个漂亮的绘图：

ggplot(tca_m, aes(gene,logFC)) +
    geom_bar(aes(fill = logFC), stat="identity", position = "dodge", width = .5) +
    coord_flip() +
    scale_fill_distiller(palette = "RdBu") +
    facet_wrap(~variable, ncol = 1)

使用

logFC

变量进行

fill

比

logP

显示更高/更低的调节，但是您可以使用您喜欢的任何一种

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谢谢你，内森！我考虑过使用facet_wrap，但只是想看看是否有一种方法可以将它们绘制在一起。此外，我使用logFC进行上/下调节，但只是想在这个图上烘焙logP（实际上是-logFDR）以显示重要性水平。您可以指定

颜色
，并允许寄宿者显示不同的组，如果您愿意，并将其保留在一个图上