如何在pheatmap R包创建的热图上添加边框？

我正在使用以下代码创建热图：

    pheatmap(tissuedata3,
    color = colorRampPalette(rev(c("#D73027", "#FC8D59", "#FEE090", "#FFFFBF", "#E0F3F8", "#91BFDB", "#4575B4")))(100),
    cellwidth = 20, cellheight = 2.8,
    border=TRUE,
    treeheight_row=0,
    treeheight_column=0,
    kmeans_k = NA,
    show_rownames = T, show_colnames = T,
    fontsize=2,
    scale="none",
    clustering_method = "complete",
    cluster_rows = FALSE, cluster_cols = TRUE,
    clustering_distance_rows = "euclidean", 
    clustering_distance_cols = "euclidean",
    legend=TRUE,
    )

---

但是，生成的热图不包含任何边界。有人知道如何将边框添加到单元格和整个热图中吗？

我认为正确的参数是

border\u color

，其默认值为“grey60”，因此我怀疑（事实证明是错误的）您从参数“border”中获得了部分名称匹配，该参数的值变为

colors（）[1]

，即[1]“白色”

尝试：

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我尝试了您的建议，但热图仍然不包含边框。当我在帮助文件中的示例中使用该参数时，我会获得边框颜色。”tissuedata3'似乎不可用。在参数中还有一个逗号，我将删除它。我还使用“测试”数据尝试了您的参数，在将“cellheight”值更改为3之前，没有任何可见的边框颜色。

library(pheatmap)
pheatmap(tissuedata3,
color = colorRampPalette(rev(c("#D73027", "#FC8D59", "#FEE090", "#FFFFBF", "#E0F3F8", "#91BFDB", "#4575B4")))(100),
cellwidth = 20, cellheight = 3,   # changed to 3
border_color="blue",
treeheight_row=0,
treeheight_column=0,
kmeans_k = NA,
show_rownames = T, show_colnames = T,
fontsize=2,
scale="none",
clustering_method = "complete",
cluster_rows = FALSE, cluster_cols = TRUE,
clustering_distance_rows = "euclidean", 
clustering_distance_cols = "euclidean",
legend=TRUE
)