将混合模型的预测绘制为R中的直线
我试图在下面绘制我的混合模型的预测(将混合模型的预测绘制为R中的直线,r,plot,regression,lme4,mixed-models,R,Plot,Regression,Lme4,Mixed Models,我试图在下面绘制我的混合模型的预测(predict()),这样我就可以在下面的一行中获得我概念上想要的图 我试着画出我的模型的预测,但我没有达到我想要的效果。有没有更好的方法来定义predict(),这样我就可以实现我想要的绘图了 library(lme4) dat3 <- read.csv('https://raw.githubusercontent.com/rnorouzian/e/master/dat3.csv') m4 <- lmer(math~pc1+pc2+disco
predict()
),这样我就可以在下面的一行中获得我概念上想要的图
我试着画出我的模型的预测,但我没有达到我想要的效果。有没有更好的方法来定义predict()
,这样我就可以实现我想要的绘图了
library(lme4)
dat3 <- read.csv('https://raw.githubusercontent.com/rnorouzian/e/master/dat3.csv')
m4 <- lmer(math~pc1+pc2+discon+(pc1+pc2+discon|id), data=dat3)
newdata <- with(dat3, expand.grid(pc1=unique(pc1), pc2=unique(pc2), discon=unique(discon)))
y <- predict(m4, newdata=newdata, re.form=NA)
plot(newdata$pc1+newdata$pc2, y)
库(lme4)
dat3正如Magnus Nordmo所建议的,这非常简单,对于这些类型的绘图,它具有一些预定义的函数
library(lme4)
dat3 <- read.csv('https://raw.githubusercontent.com/rnorouzian/e/master/dat3.csv')
m4 <- lmer(math~pc1+pc2+discon+(pc1+pc2+discon|id), data=dat3)
plot_model(m4, type = 'pred', terms = c('pc1', 'pc2'),
ci.lvl = 0)
库(lme4)
dat3正如Magnus Nordmo所建议的,这非常简单,对于这些类型的绘图,它具有一些预定义的函数
library(lme4)
dat3 <- read.csv('https://raw.githubusercontent.com/rnorouzian/e/master/dat3.csv')
m4 <- lmer(math~pc1+pc2+discon+(pc1+pc2+discon|id), data=dat3)
plot_model(m4, type = 'pred', terms = c('pc1', 'pc2'),
ci.lvl = 0)
库(lme4)
dat3MoresjPlot
。请参见参数网格
,将多个预测值包装在一个图中
library(lme4)
library(sjPlot)
library(patchwork)
dat3 <- read.csv('https://raw.githubusercontent.com/rnorouzian/e/master/dat3.csv')
m4 <- lmer(math~pc1+pc2+discon+(pc1+pc2+discon|id), data=dat3) # Does not converge
m4 <- lmer(math~pc1+pc2+discon+(1|id), data=dat3) # Converges
# To remove discon
a <- plot_model(m4,type = 'pred')[[1]]
b <- plot_model(m4,type = 'pred',title = '')[[2]]
a + b
库(lme4)
图书馆(sjPlot)
图书馆(拼凑)
dat3MoresjPlot
。请参见参数网格
,将多个预测值包装在一个图中
library(lme4)
library(sjPlot)
library(patchwork)
dat3 <- read.csv('https://raw.githubusercontent.com/rnorouzian/e/master/dat3.csv')
m4 <- lmer(math~pc1+pc2+discon+(pc1+pc2+discon|id), data=dat3) # Does not converge
m4 <- lmer(math~pc1+pc2+discon+(1|id), data=dat3) # Converges
# To remove discon
a <- plot_model(m4,type = 'pred')[[1]]
b <- plot_model(m4,type = 'pred',title = '')[[2]]
a + b
库(lme4)
图书馆(sjPlot)
图书馆(拼凑)
dat3您是否尝试过sjPlot
?太棒了!您是否尝试过sjPlot
?太棒了!Magnus,另一个问题是y轴需要在通用比例上,以便可以在绘图之间进行视觉比较。在两个轴上使用ylim()
,以对齐轴。例如,+ylim(0,2.5)
Magnus,另一个问题是y轴需要在公共刻度上,以便可以在绘图之间进行视觉比较。在两者上使用ylim()
对齐轴。例如+ylim(0,2.5)