指定colorRamp端点
我是否可以指定colorRamp的端点,以便无论其他数据的范围如何,值始终映射到单个颜色 我试图在plotly中创建一个交互式关联图。下面是一些示例数据指定colorRamp端点,r,colors,gradient,plotly,r-corrplot,R,Colors,Gradient,Plotly,R Corrplot,我是否可以指定colorRamp的端点,以便无论其他数据的范围如何,值始终映射到单个颜色 我试图在plotly中创建一个交互式关联图。下面是一些示例数据 set.seed(1) m <- 4 cm <- matrix(runif(m**2,-1,1), nrow=m, ncol=m, dimnames=list(letters[1:m],letters[1:m])) diag(cm) <- 1 cm #
set.seed(1)
m <- 4
cm <- matrix(runif(m**2,-1,1),
nrow=m, ncol=m,
dimnames=list(letters[1:m],letters[1:m]))
diag(cm) <- 1
cm
# a b c d
# a 1.0000000 -0.5966361 0.2582281 0.3740457
# b -0.2557522 1.0000000 -0.8764275 -0.2317926
# c 0.1457067 0.8893505 1.0000000 0.5396828
# d 0.8164156 0.3215956 -0.6468865 1.0000000
这是我创建的那种粗糙的交互关联图
div_colors <- c('dark red','white','navy blue')
grid_labels <- matrix(paste0('Cor(',
do.call(paste,c(expand.grid(rownames(cm),colnames(cm)), sep=', ') ),
'): ',
t(round(cm,2))
),
ncol=m,byrow=TRUE)
library(plotly)
plot_ly(x = colnames(cm),
y = rownames(cm),
z = cm,
colors = colorRamp(div_colors),
type='heatmap',
hoverinfo='text',
text = grid_labels
) %>% layout(yaxis=list(autorange='reversed'))
我的问题是,在不强制colorRamp端点为c-1,1的情况下,白色与0的相关性不匹配,暗红色映射到观察到的最小值,而不是-1。正如@rawr在评论中提到的,解决方案是: 这会产生期望的结果。图例栏较短,可能是因为较新版本的plotly中的默认大小发生了更改。
set?@rawr这很有效。如果你想写下来,我会接受你的回答。有点琐碎,但在任何例子中都没有。
div_colors <- c('dark red','white','navy blue')
grid_labels <- matrix(paste0('Cor(',
do.call(paste,c(expand.grid(rownames(cm),colnames(cm)), sep=', ') ),
'): ',
t(round(cm,2))
),
ncol=m,byrow=TRUE)
library(plotly)
plot_ly(x = colnames(cm),
y = rownames(cm),
z = cm,
colors = colorRamp(div_colors),
type='heatmap',
hoverinfo='text',
text = grid_labels
) %>% layout(yaxis=list(autorange='reversed'))
plot_ly(x = colnames(cm),
y = rownames(cm),
z = cm,
zmin=-1, # <============
zmax=1, # <============
colors = colorRamp(div_colors),
type='heatmap',
hoverinfo='text',
text = grid_labels
) %>% layout(yaxis=list(autorange='reversed'))