将每个数据帧行除以R中的向量

我试图将16列数据框中的每个数字除以每列的特定数字。数字存储为数据帧，1-16对应于较大数据帧列1-16中的样本。每列有一个数字，我需要除以较大电子表格中的每个数字，然后将输出打印到最终电子表格中

下面是我开始讲的一个例子。要划分的电子表格

            X131.478.1 X131.478.2 X131.NSC.1 X131.NSC.2 X166.478.1 X166.478.2
1/2-SBSRNA4          4          2          2          6          7          6
A1BG                93         73         88         86         58         65
A1BG-AS1           123        103         96        128         46         57

要将电子表格除以的数字

X131.478.1 1.0660880
X131.478.2 0.9104053
X131.NSC.1 0.8642545
X131.NSC.2 0.9611866
X166.478.1 0.9711406
X166.478.2 1.0560121

预期的结果，不一定像我在这里做的那样四舍五入

    X131.478.1 X131.478.2 X131.NSC.1 X131.NSC.2 X166.478.1 X166.478.2
1/2-SBSRNA4          3.75          2.19          2.31          6.24          7.20         5.68
A1BG                87.23         80.17         101.82         89.47         59.72         61.55
A1BG-AS1           115.37        113.13         111.07        133.16         47.36         53.97

我尝试简单地划分数据帧mx2=mx/sf，mx是大数据集，sf是要除以的数字的数据帧。这似乎将所有数据除以sf数据集中的第一个数字

除法的数字是由estimateSizeFactors生成的，如果有帮助的话，它是DESeq包的一部分

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任何帮助都会很好。谢谢

您可以使用

transform

mx2 <- transform(mx, 
    X131.478.1=X131.478.1/sf["X131.478.1",1],
    X131.478.2=X131.478.2/sf["X131.478.2",1],
    etc
)

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mx2仅为了多样性，您还可以使用
mapply

mx <- structure(list(X131.478.1 = c(4L, 93L, 123L), X131.478.2 = c(2L, 
73L, 103L), X131.NSC.1 = c(2L, 88L, 96L), X131.NSC.2 = c(6L, 
86L, 128L), X166.478.1 = c(7L, 58L, 46L), X166.478.2 = c(6L, 
65L, 57L)), .Names = c("X131.478.1", "X131.478.2", "X131.NSC.1", 
"X131.NSC.2", "X166.478.1", "X166.478.2"), class = "data.frame", row.names = c("1/2-SBSRNA4", 
"A1BG", "A1BG-AS1"))

sf <- structure(list(V1 = c(1.066088, 0.9104053, 0.8642545, 0.9611866, 
0.9711406, 1.0560121)), .Names = "V1", row.names = c("X131.478.1", 
"X131.478.2", "X131.NSC.1", "X131.NSC.2", "X166.478.1", "X166.478.2"
), class = "data.frame")


mapply(function(x, y) x * y, mx, t(sf))


    X131.478.1 X131.478.2 X131.NSC.1 X131.NSC.2 X166.478.1 X166.478.2
[1,]   4.264352   1.820811   1.728509    5.76712   6.797984   6.336073
[2,]  99.146184  66.459587  76.054396   82.66205  56.326155  68.640787
[3,] 131.128824  93.771746  82.968432  123.03188  44.672468  60.192690

mx
sweep
对于这些类型的操作很有用，但它需要一个矩阵作为输入。同样地，将数据帧转换为矩阵，执行该操作，然后再转换回矩阵。例如，一些虚拟数据，其中我们将矩阵
mat
的各个列中的每个元素除以向量
vec
中的相应值：

mat <- matrix(1:25, ncol = 5)
vec <- seq(2, by = 2, length = 5)

sweep(mat, 2, vec, `/`)

> vec <- df[1,]
> vec
  a b   c
1 1 3 100

要从数据帧进行转换，请使用
as.matrix（df）
或
data.matrix（df）
，并使用
as.data.frame（mat）
进行反向转换。
这只是元素矩阵乘法：

mat <- matrix(c(4,2,2,6,7,6, 93,73,88,86,58,65, 123,103,96,128,46,57), nrow=3, byrow=T)

vec = c(1.0660880,0.9104053,0.8642545,0.9611866,0.9711406,1.0560121)

mat %o% 1/vec

           [,1]      [,2]       [,3]       [,4]      [,5]      [,6]
[1,]   3.752035  2.080761   1.876018   6.242284  6.566062  6.242284
[2,] 102.152305 75.169342  96.660246  88.555663 63.707889 66.931606
[3,] 142.319190 97.536761 111.078392 121.210732 53.225063 53.976654

mat假设我们有一个数据帧，
df
：

> df
  a b   c
1 1 3 100
2 2 4 110

我们想用相同的向量除以每一行，
vec
：

mat <- matrix(1:25, ncol = 5)
vec <- seq(2, by = 2, length = 5)

sweep(mat, 2, vec, `/`)

> vec <- df[1,]
> vec
  a b   c
1 1 3 100

这只是向量的矩阵乘法；看我的答案，这只是一个向量的矩阵乘法；请看我的答案。这不适用于数据帧，而这正是问题所要求的。@Bowecho将这些运算转换为矩阵非常简单，而且确实需要，因为对数据帧执行类似操作的速度很慢。您的输出与OP的预期输出不匹配。@oshun:没错，这是元素乘法（/division）。我必须使
%*%
方法起作用。