Warning: file_get_contents(/data/phpspider/zhask/data//catemap/1/list/4.json): failed to open stream: No such file or directory in /data/phpspider/zhask/libs/function.php on line 167

Warning: Invalid argument supplied for foreach() in /data/phpspider/zhask/libs/tag.function.php on line 1116

Notice: Undefined index: in /data/phpspider/zhask/libs/function.php on line 180

Warning: array_chunk() expects parameter 1 to be array, null given in /data/phpspider/zhask/libs/function.php on line 181
基于数据帧比较的列表R子集划分_R_List_Merge_Dataframe - Fatal编程技术网

基于数据帧比较的列表R子集划分

基于数据帧比较的列表R子集划分,r,list,merge,dataframe,R,List,Merge,Dataframe,我有一个包含一系列已加载文件的列表。我希望将此列表子集,以从与另一个数据帧中的值匹配的每个文件中获取结果 例如,使用以下测试代码: data.coords1 <- c(1,6,7,9,18) data.lett1 <- c("T","T","G","C","T") data1 <- cbind(data.coords1, data.lett1) data.coords2 <- c(2,4,19,20) data.lett2 <- c("G","T","G","C

我有一个包含一系列已加载文件的列表。我希望将此列表子集,以从与另一个数据帧中的值匹配的每个文件中获取结果

例如,使用以下测试代码:

data.coords1 <- c(1,6,7,9,18)
data.lett1 <- c("T","T","G","C","T")

data1 <- cbind(data.coords1, data.lett1)

data.coords2 <- c(2,4,19,20)
data.lett2 <- c("G","T","G","C")

data2 <- cbind(data.coords2, data.lett2)

data.coords3 <- c(10,11,12,13,15,17)
data.lett3 <- c("C","T","C","C","T","G")

data3 <- cbind(data.coords3, data.lett3)

data.list <- list(data1, data2, data3)

ref.coords <- c(1:20)
ref.mark <- letters[1:20]
ref.MARK <- LETTERS[1:20]

ref <- cbind(ref.coords, ref.mark, ref.MARK)

data.coords1类似于
lappy(1:length(data.list),function(i)merge(data.list[[i]],ref,by.x=paste0(“data.coords”,i),by.y=“ref.coords”,sort=F))
可以吗?谢谢你的回答。它适用于示例代码,但我在使用真实数据时遇到了问题。我在fix.by(by.y,y)中得到了错误
错误:'by'必须指定一个我正在调查的唯一有效列
。没问题。因此,在实际数据中,没有像
data.coords1
data.coords2
data.coords3
等变量,或者是
by.y
对于列表中的所有数据集都不相同?是的,在我的实际数据中,每个列表元素中的列都是相同的。我花了一段时间才注意到出了什么问题,一定是累了。谢谢
desired.data <- merge(data2,ref, by.x="data.coords1",
                       by.y="ref.coords", sort=F)
lapply(1:length(data.list), function(i) merge(data.list[[i]],ref, by.x=paste0("data.coords",i), by.y="ref.coords", sort=F))
[[1]]
  data.coords1 data.lett1 ref.mark ref.MARK
1            1          T        a        A
2            6          T        f        F
3            7          G        g        G
4            9          C        i        I
5           18          T        r        R

[[2]]
  data.coords2 data.lett2 ref.mark ref.MARK
1            2          G        b        B
2            4          T        d        D
3           19          G        s        S
4           20          C        t        T

[[3]]
  data.coords3 data.lett3 ref.mark ref.MARK
1           10          C        j        J
2           11          T        k        K
3           12          C        l        L
4           13          C        m        M
5           15          T        o        O
6           17          G        q        Q