Warning: file_get_contents(/data/phpspider/zhask/data//catemap/4/r/71.json): failed to open stream: No such file or directory in /data/phpspider/zhask/libs/function.php on line 167

Warning: Invalid argument supplied for foreach() in /data/phpspider/zhask/libs/tag.function.php on line 1116

Notice: Undefined index: in /data/phpspider/zhask/libs/function.php on line 180

Warning: array_chunk() expects parameter 1 to be array, null given in /data/phpspider/zhask/libs/function.php on line 181
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R 如何使计数图中的所有行从控制组开始,r,ggplot2,bioconductor,rna-seq,R,Ggplot2,Bioconductor,Rna Seq,我正试图从单个基因的RNA序列数据中绘制一个计数图。我只对每个治疗组和对照组之间的比较感兴趣，我的数据是成对的，所以我试图展示这一点。通过使用DEseq2的plotCounts函数，我成功地绘制了左侧的图形（），然后稍微修改了图形。代码如下： data <- plotCounts(dds, gene="GB41122", intgroup=c("Treatment", "Home", "Behaviour"), returnData=TRUE) data <- ggplot(data

我正试图从单个基因的RNA序列数据中绘制一个计数图。我只对每个治疗组和对照组之间的比较感兴趣，我的数据是成对的，所以我试图展示这一点。通过使用DEseq2的plotCounts函数，我成功地绘制了左侧的图形（），然后稍微修改了图形。代码如下：

data <- plotCounts(dds, gene="GB41122", intgroup=c("Treatment", "Home", "Behaviour"), returnData=TRUE)
data <- ggplot(data, aes(x=Treatment, y=count, shape = Behaviour, color=Home, group=Home)) +
  scale_y_log10() + 
  geom_point() + geom_line()

data我不知道如何更改行，但要重新调整治疗级别，请尝试将以下内容添加到代码中：


+刻度x_离散（限值=c（“Ctr”，“CO1”，“CO2”））
？将系数
处理重新分级
，Ctr
作为第一级。