R自行删除了所有软件包，无法再安装

突然，我的

R

安装（在Ubuntu 16.04上运行）输出

R执行错误

并关闭。重新打开会话（在

RStudio

）后，我发现

R

删除了我计算机上现有的所有软件包（或者更好的是，再也找不到任何软件包）：我尝试重新安装了所有软件包，但我总是在库（）中遇到

错误：无论我尝试安装什么软件包，都没有名为

的软件包。例如：

> install.packages("data.table")

trying URL 'https://cran.rstudio.com/src/contrib/data.table_1.10.4.tar.gz'
Content type 'application/x-gzip' length 3068135 bytes (2.9 MB)
==================================================
downloaded 2.9 MB

Error in library(data.table) : there is no package called ‘data.table’
Execution halted
Warning in install.packages :
  installation of package ‘data.table’ had non-zero exit status

The downloaded source packages are in
    ‘/tmp/Rtmpl1WV2b/downloaded_packages’

其他的也一样。我尝试过手动更换CRAN mirror，但这与此无关。如果我这样做

> .libPaths()
[1] "/home/user/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.4"
[2] "/usr/local/lib/R/site-library"                  
[3] "/usr/lib/R/site-library"                        
[4] "/usr/lib/R/library"

所有这些都是空的（以前不是，现在是，似乎一切都被抹去了）。然而

ls -l /tmp/Rtmpl1WV2b/downloaded_packages
total 3000
-rw-rw-r-- 1 user 3068135 Jun 23 04:05 data.table_1.10.4.tar.gz

---

因此，尽管R中出现了错误消息，但软件包还是以某种方式下载到了某个地方。知道这里发生了什么吗？

除非您另有指定，否则R会尝试（并且会尝试，除非出现权限问题）将软件包安装到

.libpath（）

返回的第一个路径。更新R本身通常（有意地）将

.libPaths（）

更改为附加到该版本的空新目录（使用旧版本构建的包可能会引入错误），但如果您仔细查看，包的旧目录通常仍在文件系统中。假设没有删除所有内容，请搜索这些文件并将

.libPaths

设置到适当的目录。或者，如果您愿意，可以删除所有内容并重新开始。您刚刚升级到R 3.4吗？事实上，我刚刚将R升级到了3.4。@alistaire即使手动更改安装位置，甚至从头开始卸载和重新安装R，软件包的安装仍然处于非零退出状态，没有任何其他口头解释。这是新R版本的常见问题吗？除非您另有指定，否则R会尝试（并且确实会，除非出现权限问题）将程序包安装到

.libPaths（）

返回的第一个路径。更新R本身通常（有意地）将

.libPaths（）

更改为附加到该版本的空新目录（使用旧版本构建的包可能会引入错误），但如果您仔细查看，包的旧目录通常仍在文件系统中。假设没有删除所有内容，请搜索这些文件并将

.libPaths

设置到适当的目录。或者，如果您愿意，可以删除所有内容并重新开始。您刚刚升级到R 3.4吗？事实上，我刚刚将R升级到了3.4。@alistaire即使手动更改安装位置，甚至从头开始卸载和重新安装R，软件包的安装仍然处于非零退出状态，没有任何其他口头解释。这是新R版本的一般问题吗？