绘制平均值和标准偏差。R中对数数据的处理

我想以对数标度绘制一些存储在两个向量（x和y）中的数据。 此外，我想添加平均值和标准偏差（后者使用条形图）

我的问题是，y-data-vector中有零，“mean”函数然后获取log（0）（=-Inf）作为参数，并返回-Inf

qplot（x，y，log=“xy”）+统计摘要（fun.y=mean，geom=“point”）

如何使“平均值”函数在“正常”数据上工作，而不是在记录的数据上工作

干杯

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Manuel

阅读

coord\u trans

的帮助页面。使用

coord_trans（xtrans='log10'，ytrans='log10'）

将帮助您创建一个日志图，因为坐标转换是在计算完所有统计数据之后进行的。

在转换之前计算统计数据

现在忽略对数刻度，我想你想要画的是这样的

p <- ggplot(dfr) + 
  geom_point(aes(x, y)) +       
  geom_point(
    aes(
      x = mean(x), 
      y = mean(y)
    ), 
    colour = "blue",
    size = 5
  ) +
  geom_rect(
    aes(
      xmin = mean(x) - sd(x),
      xmax = mean(x) + sd(x), 
      ymin = mean(y) - sd(y),
      ymax = mean(y) + sd(y)
    ),
    alpha = 0.2
  ) 
p

当然，零不会显示在图形上，因为它们不应该显示。要处理它们，您可以选择从数据集中删除它们还是替换一个小的正数

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编辑：如果您希望y值的统计数据按x值分组，听起来您的x变量是一个因子，在这种情况下，您可能需要一个条形图。柱状图的对数y刻度是个坏主意，但你可以用平方根变换来代替。

嗨，里奇，谢谢你的回答。对不起，我没有完全写下我想要的：我不想要中庸和标准。除平均值和标准偏差外，所有数据中。对于每个x坐标的所有y数据点。好的，我刚刚在我的值中添加了1e-5；）

p +
  scale_x_log10() + 
  scale_y_log10()