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R中的部分正则对应分析

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R中的部分正则对应分析,r,vegan,R,Vegan,在R中进行部分规范对应分析（pCCA）时，我遇到了一些问题。与代码相关的数据非常广泛，因此我无法将其包括在这里 下面的代码在下面生成错误。在pCCA模型中，我试图在解释物种矩阵时考虑环境和空间变量。空间变量是纬度和经度值。Env2变量是一系列连续的和少量的二进制（0,1）环境变量 mod2 <-cca(species ~ env2 + spatial) Error in model.frame.default(~env2 + spatial, na.action = na.pass, xl

在R中进行部分规范对应分析（pCCA）时，我遇到了一些问题。与代码相关的数据非常广泛，因此我无法将其包括在这里

下面的代码在下面生成错误。在pCCA模型中，我试图在解释物种矩阵时考虑环境和空间变量。空间变量是纬度和经度值。Env2变量是一系列连续的和少量的二进制（0,1）环境变量

mod2 <-cca(species ~ env2 + spatial)
Error in model.frame.default(~env2 + spatial, na.action = na.pass, xlev = NULL) : invalid type (list) for variable 'env2'

mod2公式右侧必须有变量，但似乎有多个变量的数据框。这将不起作用，但会给出与您的帖子中类似的错误消息（这是有文档记录的）。此外，您的公式不会定义部分CCA，因为该公式不包含定义部分调用的术语的函数
Condition（）

如果将数值矩阵作为术语，公式接口可能会工作，但它不适用于
unlist（）
变量


mod2 <-cca(species ~ env2 + spatial)
Error in model.frame.default(~env2 + spatial, na.action = na.pass, xlev = NULL) : invalid type (list) for variable 'env2'


如果您使用的是素食主义者2.5-1或更新版本，您可以将不带配方界面的部分CCA定义为


cca（物种、环境2、空间）



数据帧
env2
和
spatial
会自动展开为模型矩阵，在分析
env2
术语的影响之前，会将
spatial
术语分割出来。
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