R:在两个数据帧中跨多个列计算ICC
我正在计算两个读卡器的301个变量的ICC。结果保存在两个文件中,每个文件有301列。file1的第一列(reader1$Var1)对应于file2的第一列(reader2$Var302)。我可以手动执行ICC(见下文),但我需要帮助使用apply或循环自动执行此过程。多谢各位R:在两个数据帧中跨多个列计算ICC,r,loops,statistics,R,Loops,Statistics,我正在计算两个读卡器的301个变量的ICC。结果保存在两个文件中,每个文件有301列。file1的第一列(reader1$Var1)对应于file2的第一列(reader2$Var302)。我可以手动执行ICC(见下文),但我需要帮助使用apply或循环自动执行此过程。多谢各位 library(irr) irr::icc() a= data.frame(reader1$Var1) b= data.frame(reader2$Var302) X= data.frame (a,b) function
library(irr)
irr::icc()
a= data.frame(reader1$Var1)
b= data.frame(reader2$Var302)
X= data.frame (a,b)
function.ICC <- function (X) {irr::icc(X, model =c("oneway"), type = c("consistency"), unit =("single"), r0 = 0, conf.level = 0.95)}
Results <- function.ICC(X)
Results[7]
库(irr)
内部收益率::国际商会()
a=data.frame(reader1$Var1)
b=data.frame(reader2$Var302)
X=数据帧(a,b)
function.ICC将lappy
和do.call
组合在一起可以解决您的问题(尽管有很多选择)。您没有提供数据样本,因此我假设您首先对两个数据帧逐个执行cbind
,因此在本示例中
> X = data.frame(cbind(1:10, 11:20, 21:30, 21:30))
> X
X1 X2 X3 X4
1 1 11 21 21
2 2 12 22 22
3 3 13 23 23
4 4 14 24 24
5 5 15 25 25
6 6 16 26 26
7 7 17 27 27
8 8 18 28 28
9 9 19 29 29
10 10 20 30 30
您希望运行X1对X3和X2对X4的icc
。根据您定义的function.ICC
,它将类似于以下内容:
> do.call(cbind, lapply(1:2, function(i) function.ICC(X[,c(i, i+2)])))
[,1] [,2]
subjects 10 10
raters 2 2
model "oneway" "oneway"
type "consistency" "consistency"
unit "single" "single"
icc.name "ICC(1)" "ICC(1)"
value -0.8320611 -0.4634146
r0 0 0
Fvalue 0.09166667 0.3666667
df1 9 9
df2 10 10
p.value 0.9993158 0.926668
conf.level 0.95 0.95
lbound -0.9526347 -0.8231069
ubound -0.4669701 0.1848105
因此,对于具有301列的cbind'ed数据帧,类似于此的内容应该可以工作:
do.call(cbind, lapply(1:301, function(i) function.ICC(X[,c(i, i+301)])))