R：如何按组别给箱线图上的样品上色？

我目前有一个矩阵中的基因表达数据，按列中的样本排列，按行中的基因排列。我有大约300个样本和30000个基因

数据的前三行如下所示：

         Sample1  Sample2  Sample3   Sample4   Sample5
Gene1    6.53845  6.38723  6.41613   6.07901   6.45148
Gene2    6.34303  6.52751  6.48025   6.79185   6.94955
Gene3    6.17286  6.31772  6.44266   6.61777   7.05509
...      ...    

以此类推，最多可存储30000行和300个样本

我已经能够使用R绘制数据的箱线图，但我现在希望根据样品的批次/组给箱线图上色

我有一个这样的批次信息表

Sample   Batch
Sample1  A
Sample2  A
Sample3  B
Sample4  A
Sample5  C
...      ...

---

等8批。使用R，我应该如何根据样本所属批次为箱线图着色？谢谢

方法之一是

图书馆弹琴 图书馆三年 可供图书馆使用 图书馆GGPLOT2 df%>% 行名\u到\u columnGenes%>%将行名添加为列 gatherSample，Sample_值，-Genes%>%将数据从宽格式转换为长格式以进行绘图 left_joinbatch_lookup，by=Sample%>%将其与查找表连接以添加“Batch”列 ggplotaesx=样本，y=样本_值，颜色=批次+绘图数据 几何箱线图 哪个阴谋

样本数据：

---

类似于箱线图…，col=as.factorbatch\u info\u df$Batch。你能发布你用来生成箱线图的代码吗？你好，现在我只是在使用，我可以简单地给出我的数据矩阵作为参数：boxplotdata.matrix，col='red'你好，这很好用！这也是我第一次尝试使用ggplot，所以我想知道是否有一种方法可以在boxplot中将批次分组在一起？所以前3个是批次A和红色等等。我想我在这里遗漏了一些东西，所以请你对你的后续问题进行更详细的描述？很抱歉反应太晚！你好，不用担心。我实际上意识到这是一个愚蠢的问题，真的，我想批量绘制箱线图而不是样本。我只需要设置x=Batch，仅此而已。谢谢你的帮助！

df <- structure(list(Sample1 = c(6.53845, 6.34303, 6.17286), Sample2 = c(6.38723, 
6.52751, 6.31772), Sample3 = c(6.41613, 6.48025, 6.44266), Sample4 = c(6.07901, 
6.79185, 6.61777), Sample5 = c(6.45148, 6.94955, 7.05509)), .Names = c("Sample1", 
"Sample2", "Sample3", "Sample4", "Sample5"), class = "data.frame", row.names = c("Gene1", 
"Gene2", "Gene3"))

batch_lookup <- structure(list(Sample = c("Sample1", "Sample2", "Sample3", "Sample4", 
"Sample5"), Batch = c("A", "A", "B", "A", "C")), .Names = c("Sample", 
"Batch"), class = "data.frame", row.names = c(NA, -5L))