R 包含不同尖端标签的树之间的颜色代码链接

R 包含不同尖端标签的树之间的颜色代码链接,r,plot,tree,color-coding,R,Plot,Tree,Color Coding,所以我有两棵树:一棵是植物物种的系统发育树,另一棵是根据营养成分对植物物种进行分类的树。我试图使用R包cophyloplot链接这两个树中的相应提示 另外,为了使这个图形更直观,我想通过对连接物种的线条进行颜色编码来分解物种。问题是,营养树比进化树有更多的提示,因为一些同一物种的植物具有不同的食物(例如,花椰菜和芥菜是不同的食物,具有不同的营养特征,但属于同一种芸苔属植物)。 所以,在进化树中,我有一个叫做芸苔属的尖端,它映射到营养树中的几个尖端。Cophyloplot允许重叠提示,所以我仍然可

所以我有两棵树:一棵是植物物种的系统发育树,另一棵是根据营养成分对植物物种进行分类的树。我试图使用R包cophyloplot链接这两个树中的相应提示

另外,为了使这个图形更直观,我想通过对连接物种的线条进行颜色编码来分解物种。问题是,营养树比进化树有更多的提示,因为一些同一物种的植物具有不同的食物(例如,花椰菜和芥菜是不同的食物,具有不同的营养特征,但属于同一种芸苔属植物)。 所以,在进化树中,我有一个叫做芸苔属的尖端,它映射到营养树中的几个尖端。Cophyloplot允许重叠提示,所以我仍然可以显示从一棵树上的一个提示到另一棵树上的多个提示的多个连接。然而,当我尝试对其进行颜色编码时,它不起作用(下面显示了具有代表性的理想输出)。

我遵循这个例子:并且已经让它与一组不同的树一起工作(那些树有相同的技巧)。我想知道是否有人对我如何继续有任何见解。我试着从Dendestend包中查看tanglegram函数,但这只适用于具有相同提示的树。感谢您的帮助!谢谢