关于GGR图中不同群的着色点

我正在用ggplot绘制两个向量，并希望根据它们的超级填充标记（总共6个超级贴图，并使用我的个人调色板mypal）为结果离散点上色。我有一个名为newPC2的数据帧，它有三列：PC1（x向量）、PC2（y向量）和superpap（人口标签，“EUR”、“AMR”）。当我尝试执行以下操作时：

mypalette=c("blue","violetred1","green1","darkorchid1","yellow1","black")

ggplot(newPC2, aes(PC1, PC2, fill=Superpopulations2)) + 
  geom_point(size = 2.5) +
  scale_color_manual(values = mypalette) +
  theme(legend.position="bottom")

所有图形点都显示为黑色。我想让这些点用6种颜色中的一种来表示它的叠加，看看它们是如何分布的（它们是PCA结果）

有什么想法吗？谢谢大家!

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在

ggplot

中，默认的点几何图形是16（一个点），因此没有填充美学，只有颜色。这意味着您必须将SuperPopulations2变量映射到颜色，最终代码如下所示：

ggplot(newPC2, aes(PC1, PC2, color=Superpopulations2)) + 
  geom_point(size = 2.5) +
  scale_color_manual(values = mypalette) +
  theme(legend.position="bottom")

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这有一些关于使用形状的非常有用的信息。

您的

ggplot

调用的开始应该更改为

ggplot（newPC2，aes（PC1，PC2））

对不起，我无意中发布了一个旧问题。我已经解决了你要回答的问题，但现在我用我想问的问题编辑了它。请再看一遍，对不起！将

fill

更改为

color

。您正在使用

scale\u color\u手册

但正在设置

fill=

美学<代码>颜色和填充是两种不同的美学。但看起来还是很奇怪，他们都是黑人。听起来你把情节主题搞砸了。尝试运行<代码> TeMeSET（TeMeGRY（））< /C> >重置为默认值，或者如果它不起作用，重新启动R。使用一个带有示例输入数据的SO总是一个好主意，这样我们就可以运行和测试正在发生的事情。也可以考虑将<代码>名称>代码>添加到您的调色板中，以确保一致的映射。