RMarkdown中中介函数的输出
我试图将中介包中的RMarkdown中中介函数的输出,r,r-markdown,R,R Markdown,我试图将中介包中的mediate函数的输出包含在我的RMarkdown(PDF)文档中。使用summary将RMarkdown转换为PDF文档时,它会给出一个包含自举分析结果的表格,但是: 我不喜欢输出的外观,我希望有一个更闪亮的桌子 我无法用标题标记此表,并且它不包含在RMarkdown的自动nummeration中(因此,我无法在文本中引用它) 我尝试将kable或xtabs与'mediate'函数的输出一起使用,但由于这两个函数都不接受输出的类(“summary.mediate”“medi
mediate
函数的输出包含在我的RMarkdown(PDF)文档中。使用summary
将RMarkdown转换为PDF文档时,它会给出一个包含自举分析结果的表格,但是:
kable
或xtabs
与'mediate'函数的输出一起使用,但由于这两个函数都不接受输出的类(“summary.mediate”“mediate”),因此无法工作
这就是我的RMarkdown文档中的代码块的运行方式:
```{r med.y1.z6.z7.c, echo = F, comment = "", strip.white = T, fig.cap="test"}
regDFM <- na.omit(as.data.frame(cbind(Y1, X1, Z1, Z6, Z7)))
regFIT1.C.medY <- lm(Y1 ~ X1+Z1+Z6+Z7+X1:Z1, data = regDFM)
regFIT1.C.medM <- lm(Z7 ~ X1+Z1+Z6+X1:Z1, data = regDFM)
fitMED <- mediation::mediate(regFIT1.C.medM, regFIT1.C.medY,
boot = T, sims = 10, treat="Z6", mediator="Z7")
summary(fitMED)
```
``{r med.y1.z6.z7.c,echo=F,comment=”“,strip.white=T,fig.cap=“test”}
使用kable和mediate函数的元素,我最终创建了一个漂亮的RMarkdown>PDF输出
首先,我使用mediate函数的相关元素创建了一个data.frame(被称为“元素”吗?你会怎么称呼它们?)。然后将data.frame传递给kable
感谢@henrik_ibsen的提示
这是我的密码:
regDFM <- na.omit(as.data.frame(cbind(Y1, X1, Z1, Z6, Z7)))
regFIT1.C.medY <- lm(Y1 ~ X1+Z1+Z6+Z7+X1:Z1, data = regDFM)
regFIT1.C.medM <- lm(Z7 ~ X1+Z1+Z6+X1:Z1, data = regDFM)
fitMED <- mediation::mediate(regFIT1.C.medM, regFIT1.C.medY,
boot = T, sims = 10, treat="Z6", mediator="Z7")
bt_effect <- c("Indirekter Effekt", "Direkter Effekt", "Gesamt Effekt",
"Anteil direkter Effekt")
bt_est <- c(fitMED$d1, fitMED$z1, fitMED$tau.coef, fitMED$n1)
#bt_p <- format.pval(c(fitMED$d1.p, fitMED$z1.p, fitMED$tau.p, fitMED$n1.p))
bt_p <- c(fitMED$d1.p, fitMED$z1.p, fitMED$tau.p, fitMED$n1.p)
bt_stars <- c(stars.pval(fitMED$d1.p), stars.pval(fitMED$z1.p),
stars.pval(fitMED$tau.p), stars.pval(fitMED$n1.p))
bt_DF <- data.frame(row.names = bt_effect, format(bt_est, digits = 2),
format(bt_p, nsmall = 3), bt_stars)
colnames(bt_DF) <- c("Koeffizienten", "p-Werte", "")
kable(bt_DF, booktabs = T, align = "c",
caption = "Bootstraping-Analyse für Mediation") %>%
footnote(general = c("Simulationen: 1000", "Signifikanzniveaus: ∗ p<0.05;
∗∗ p<0.01; ∗∗∗ p<0.001"),
general_title = "Anmerkungen:")
regDFM使用kable和mediate函数的元素,我最终创建了一个漂亮的RMarkdown>PDF输出
首先,我使用mediate函数的相关元素创建了一个data.frame(被称为“元素”吗?你会怎么称呼它们?)。然后将data.frame传递给kable
感谢@henrik_ibsen的提示
这是我的密码:
regDFM <- na.omit(as.data.frame(cbind(Y1, X1, Z1, Z6, Z7)))
regFIT1.C.medY <- lm(Y1 ~ X1+Z1+Z6+Z7+X1:Z1, data = regDFM)
regFIT1.C.medM <- lm(Z7 ~ X1+Z1+Z6+X1:Z1, data = regDFM)
fitMED <- mediation::mediate(regFIT1.C.medM, regFIT1.C.medY,
boot = T, sims = 10, treat="Z6", mediator="Z7")
bt_effect <- c("Indirekter Effekt", "Direkter Effekt", "Gesamt Effekt",
"Anteil direkter Effekt")
bt_est <- c(fitMED$d1, fitMED$z1, fitMED$tau.coef, fitMED$n1)
#bt_p <- format.pval(c(fitMED$d1.p, fitMED$z1.p, fitMED$tau.p, fitMED$n1.p))
bt_p <- c(fitMED$d1.p, fitMED$z1.p, fitMED$tau.p, fitMED$n1.p)
bt_stars <- c(stars.pval(fitMED$d1.p), stars.pval(fitMED$z1.p),
stars.pval(fitMED$tau.p), stars.pval(fitMED$n1.p))
bt_DF <- data.frame(row.names = bt_effect, format(bt_est, digits = 2),
format(bt_p, nsmall = 3), bt_stars)
colnames(bt_DF) <- c("Koeffizienten", "p-Werte", "")
kable(bt_DF, booktabs = T, align = "c",
caption = "Bootstraping-Analyse für Mediation") %>%
footnote(general = c("Simulationen: 1000", "Signifikanzniveaus: ∗ p<0.05;
∗∗ p<0.01; ∗∗∗ p<0.001"),
general_title = "Anmerkungen:")
regDFM您可以查看summary.mediate
的源代码,并创建自己的summary函数,该函数只将相关信息输出为data.frame
。看一看谢谢!这听起来是个好主意,很有趣,但很费时。如果我有时间,我会试试。你可以查看摘要的源代码。调解并创建自己的摘要函数,该函数只将相关信息作为数据.frame
输出。看一看谢谢!这听起来是个好主意,很有趣,但很费时。如果我有时间,我会试试的。