使用R中的光栅对大型ArcGIS栅格文件进行降额

我试图提取大型ArcGIS网格文件的各种属性，类似于

即使使用较小的文件裁剪版本，操作也很慢，但更重要的是，需要一个很多GB的临时文件，最终会耗尽我的硬盘，导致操作失败。我在这个驱动器上有大约35 GB的可用空间

foo <- raster("grid/w001001.adf")
allLayers <- deratify(foo)

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我对河流温度数据进行计算，这些数据通常是数百万条记录。每当遇到内存问题时，我都会将gc（）和rm（）函数合并到处理数据的循环中。您可以考虑在循环中使用这些函数来处理裁剪文件，这样RM-（）可以从R环境中移除不需要的对象，而GC.（）将内存返回给您的系统。

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如果您有一个多核系统，则可以将其放入一个循环中，以批处理所有裁剪的文件，并在每个节点完成一个循环的deratify（）调用后进行清理。如果没有更多的代码，就很难建议如何实现。

如果有一个类似结构的较小文件，我们将不胜感激。这是900+MB，林服务的服务器速度很慢。我自己还没有测试过，但是这个文件的格式是相同的。大小显然是我遇到的问题的一部分，因此将此链接发布到上面的文件。deratify将为每个属性创建一个层。有多少属性？有180层；但是，我遇到了磁盘空间问题，试图对单个属性进行降额，这会在后台为每个属性创建一个层吗？我尝试使用Windows R上的重新设置。我将ProcMon附加到rsession.exe，但没有看到由rsession.exe创建的任何临时文件。临时文件是由R、光栅还是OSX创建的？谢谢你的回答，我现在没有使用任何循环。提供的示例实际上是我试图运行的所有代码。空间中没有

rm（）

和

gc（）

可以帮助的RAM，而是由

光栅

包生成的临时文件的大小

allLayers <- deratify(fooCropped, att="BA_GE_3")

> R.Version()
$platform
[1] "x86_64-apple-darwin15.3.0"
$arch
[1] "x86_64"
$os
[1] "darwin15.3.0"
$system
[1] "x86_64, darwin15.3.0"
...

‘raster’ version 2.5-2 
R version 3.2.4