R中的y轴标签以及如何将x轴更改为R中的特定增量

我想创建一个绘图，x轴增量为500000，y轴上有

sampleid

。以下代码可以创建绘图，但y轴标签不起作用，我不确定如何对x轴记号进行编码。此外，我必须手动将标题添加到数据文件中（然后在分配

d

时添加

header=TRUE

），以使代码正常工作。我不应该把专栏标题放进去，是吗？因为我使用了setNames

   d = read.delim("n_reads_per_sample.tsv", header = TRUE, sep = "\t")

xticks <- ( ? increments of 500000 to xmax ? )
dotchart(
  sort(setNames(d$n_reads, d$X.sample)),
  xlim = c(0, at = xticks, 1 max(d$n_reads)),
  labels = dimnames(d[[1]])
  ,
  main = "reads per sample",
  xlab = "number of reads",
  ylab = "sample"
)

---

我现在不能得到你的全部数据，所以我只是在问题中使用你的样本。 不确定y轴标签不起作用是什么意思。在我看来，它们还不错。通过抑制由

点图

生成的x轴，然后使用

轴

功能生成自己的轴，可以获得所需的x轴标签。这需要用

par

进行一点别致的步法。此外，除非伸出图形窗口，否则将没有足够的空间打印所有轴标签。我缩小了字体大小并拉伸了窗口以获得下图

UpperLimit <- ceiling(max(d$n_reads)/500000)*500000
xticks <- seq(0,UpperLimit, 500000)

par(xaxt = "n")
dotchart(
  sort(setNames(d$n_reads, d$X.sample)),
  xlim=c(0, UpperLimit),
  labels = dimnames(d[[1]]),
  main = "reads per sample",
  xlab = "number of reads",
  ylab = "sample"
)
par(xaxt = "s")
axis(1, at=xticks, cex.axis=0.7) 

---

关于轴的上限很好，谢谢。奇怪的是dimnames适合你。我确实输入了你的代码，但在我的图上仍然没有y轴标签。当我输入“d[[1]]”时，所有样本编号都打印得很好。但当我键入“labels=dimnames（d[[1]]），然后键入“labels”以查看标签包含名称向量时，返回“NULL”。这能说明问题吗？太好了。此外，dotchart手册中说“为每个点标记一个标签向量。对于向量，默认使用名称（x），对于矩阵，行标签dimnames（x）[[1]]”，因此我认为我的论点不太正确。这里有一些值得检查的地方。描述数据时，您有
x.sample
（小写x）。您的setNames语句具有
d$X.sample
（大写X）。你的代码一致吗？我已经把这两个都变成了
X
（大写）。如果你错了，它会产生你得到的结果（没有名字）啊，我明白了，我的文件不是作为数字向量或矩阵读取的，这是点图工作所需要的，标签函数工作所需要的。我的文件正在作为数据帧读取。我只是在尝试如何强制创建一个矩阵，但仍然保留我的y轴标签。当我制作上面的图表时，我使用了data.frame。你检查过x.sample和x.sample吗？
UpperLimit <- ceiling(max(d$n_reads)/500000)*500000
xticks <- seq(0,UpperLimit, 500000)

par(xaxt = "n")
dotchart(
  sort(setNames(d$n_reads, d$X.sample)),
  xlim=c(0, UpperLimit),
  labels = dimnames(d[[1]]),
  main = "reads per sample",
  xlab = "number of reads",
  ylab = "sample"
)
par(xaxt = "s")
axis(1, at=xticks, cex.axis=0.7)