R 如何根据匹配的前缀/后缀合并两个字符串？

我正在尝试根据匹配的后缀/前缀合并两个字符串。例如，给定下面的两个字符串“a”和“b”，我首先使用

Biostrings:：pairwiseallignment

获取它们的公共后缀/前缀，在本例中是“cutie”。然后我需要合并这两个字符串。连接不会有帮助，因为我会得到重复

这就是我目前所拥有的一切：

a= "bahahahallocutie"
b = "cutiepalaohaha"
pairwiseAlignment(a, b, type = "overlap")

这给了我：

Overlap PairwiseAlignmentsSingleSubject (1 of 1)
pattern: [12] cutie
subject:  [1] cutie
score: 17.20587 

我想得到的是通过一个后缀和另一个前缀的模式合并两个字符串：

 "bahahahallocutiepalaohaha"

---

您可以从

成对对齐的结果中提取模式。然后使用
gsub
从字符串中删除模式，您可以使用
paste0
获得所需的合并字符串。请注意，在最终代码中，您需要考虑原始字符串的顺序

library(Biostrings)
pat <- pairwiseAlignment(a, b, type = "overlap")@pattern
paste0(gsub(pat, "", a), pat, gsub(pat, "", b))
# [1] "bahahahallocutiepalaohaha"

库（生物串）
pat请不要假设每个人都知道哪个包
pairwiseAlignment
。您应该在示例中包括对
库的调用。