在RStudio中运行cron作业

我正试图通过EC2实例上的RStudio计划一个cron作业。
当我使用带有非常基本函数的基本脚本时，它工作得很好。 但是，当我想要调度一个包含specfic R包中的R函数的脚本时，脚本会失败

我的cron看起来像这样：

MAILTO="myemail@adress.com"
36 * * * * /home/user1/Test_for_Cron.R

启动脚本后，我收到一封来自Cron守护进程的电子邮件，指定如下内容：

R\u函数中出现错误： 找不到函数R\u函数
停止执行

根据我的发现，似乎我必须指定我要在RStudio中运行脚本，或者我要“源”它。
我觉得答案可能是以下3篇文章的组合，但在测试了一些建议后，我没有找到解决方案：

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非常感谢您的帮助

您误解了

cron

和shell命令的工作原理——R文件是不可执行的（除非您对其进行更改，请参见下文）

但是如果您只是在它前面加上

Rscript

，您就可以 1.在shell中测试它，直到它工作为止 2.由

cron

执行

36 * * * * Rscript /home/user1/Test_for_Cron.R

编辑：如果执行以下两项操作，则可以使其可执行：

• 添加一个

  shebang

  行

  #/usr/bin/Rscript

  （或指向

  Rscript

  的任何路径）
• 通过chmod 755 Test\u for_Cron.R将模式更改为可执行模式，该模式为您（所有者）设置读/写/执行，为组和其他人设置读/执行

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您误解了cron和shell命令的工作原理——R文件是不可执行的（除非您对其进行更改，请参见下文）

但是如果您只是在它前面加上

Rscript

，您就可以 1.在shell中测试它，直到它工作为止 2.由

cron

执行

36 * * * * Rscript /home/user1/Test_for_Cron.R

编辑：如果执行以下两项操作，则可以使其可执行：

• 添加一个

  shebang

  行

  #/usr/bin/Rscript

  （或指向

  Rscript

  的任何路径）
• 通过chmod 755 Test\u for_Cron.R将模式更改为可执行模式，该模式为您（所有者）设置读/写/执行，为组和其他人设置读/执行
谢谢你，德克。 是的，我已经添加了

#/将usr/bin/Rscript

添加到我的脚本中。 问题实际上来自一个简单的事实，即一些库没有加载到我的脚本中，从而导致错误并停止脚本。 现在，所有库都已加载，工作正常
谢谢你，德克。 是的，我已经添加了

#/将usr/bin/Rscript

添加到我的脚本中。 问题实际上来自一个简单的事实，即一些库没有加载到我的脚本中，从而导致错误并停止脚本。

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现在，所有库都已加载，工作正常
也许可以尝试通过打印Sys.info（）来启动脚本，以检查cron是否找到了正确的R二进制文件（和库）-我有类似于此问题的smthg+问题是cron找到了错误版本的RWhen I do Sys.info（）我没有看到任何关于R库hoops的信息，请尝试

.libpath（）

和

R.version

--这会有相关的信息，也许可以尝试通过打印Sys.info（）来启动脚本，以检查cron是否找到了正确的R二进制文件（和库）-我有过类似此问题的smthg+问题是当我执行Sys.info（）时，cron找到了错误的rw版本我没有看到关于R库hoops的任何信息，请尝试

.libpath（）

和

R.version

——这将包含相关信息