如何从mcmc RJAG中提取数据
我正在运行下面的模型,在这个模型中,我得到了每个投票周的测量值。为每一方产生100多个阿尔法向量。可能的问题是,我怎样才能以画线图的方式储存它们如何从mcmc RJAG中提取数据,r,jags,r2jags,R,Jags,R2jags,我正在运行下面的模型,在这个模型中,我得到了每个投票周的测量值。为每一方产生100多个阿尔法向量。可能的问题是,我怎样才能以画线图的方式储存它们 model{ ## measurement for(i in 1:NPOLLS){ p1[i] ~ dnorm(alpha1[WoY[i]] + pollster1[org[i]], prec1[i]) p2[i] ~ dnorm(alpha2[WoY[i]] + pollster2[org[i]], prec2[
model{
## measurement
for(i in 1:NPOLLS){
p1[i] ~ dnorm(alpha1[WoY[i]] + pollster1[org[i]], prec1[i])
p2[i] ~ dnorm(alpha2[WoY[i]] + pollster2[org[i]], prec2[i])
p3[i] ~ dnorm(alpha3[WoY[i]] + pollster3[org[i]], prec3[i])
}
## transition
for(i in 2:NPERIODS){
alpha1[i] ~ dnorm(alpha1[i-1],phi1)
alpha2[i] ~ dnorm(alpha2[i-1],phi2)
alpha3[i] ~ dnorm(alpha3[i-1],phi3)
}
pollster1[1] <- -sum(pollster1[2:NPOLLSTERS])
pollster2[1] <- -sum(pollster2[2:NPOLLSTERS])
pollster3[1] <- -sum(pollster3[2:NPOLLSTERS])
## priors
phi1 ~ dgamma(5000,1)
alpha1[1] ~ dunif(.2,.4)
phi2 ~ dgamma(5000,1)
alpha2[1] ~ dunif(.2,.4)
phi3 ~ dgamma(10000,1)
alpha3[1] ~ dunif(.1,.3)
for(i in 2:NPOLLSTERS){
pollster1[i] ~ dnorm(0,.01);
pollster2[i] ~ dnorm(0,.01);
pollster3[i] ~ dnorm(0,.01);
} }
jags函数为mmcm.list对象提供了此类对象的摘要通用函数。
在jags函数返回的新对象上使用str和name函数,您需要找到类似mcmc的内容。mcmcsub对象是mcmc.list类的矩阵,包含后验数,其中n行为迭代数,n列为估计参数。所以你可以提取你想要的。mcmc对象的长度等于链的数量。它们还有一个通用的plot.mcmmc函数来绘制后验密度。mcmc对象的摘要?