R 向量场可视化

R 向量场可视化,r,vector,plot,R,Vector,Plot,我有一个有很多行的大文本文件。每行对应一个向量。 这是每行的示例: x y dx dy 99.421875 52.078125 0.653356799108 0.782479314511 前两列是向量行距的坐标。第二列和第二列是坐标增量(终点减去起点)。 我需要制作这个向量场的图片(一张图片上的所有向量)。 我怎么能这样做? 谢谢使用ggplot2,您可以执行以下操作: library(grid

我有一个有很多行的大文本文件。每行对应一个向量。 这是每行的示例:

        x           y               dx              dy
99.421875   52.078125   0.653356799108  0.782479314511
前两列是向量行距的坐标。第二列和第二列是坐标增量(终点减去起点)。 我需要制作这个向量场的图片(一张图片上的所有向量)。 我怎么能这样做?
谢谢

使用
ggplot2
,您可以执行以下操作:

library(grid) 
df <- data.frame(x=runif(10),y=runif(10),dx=rnorm(10),dy=rnorm(10))
ggplot(data=df, aes(x=x, y=y)) + geom_segment(aes(xend=x+dx, yend=y+dy), arrow = arrow(length = unit(0.3,"cm")))
库(网格)

df好的,这里有一个基本解决方案:

DF <- data.frame(x=rnorm(10),y=rnorm(10),dx=runif(10),dy=runif(10))
plot(NULL, type = "n", xlim=c(-3,3),ylim=c(-3,3))
arrows(DF[,1], DF[,2], DF[,1] + DF[,3], DF[,2] + DF[,4])
DF如果有大量数据(问题是“大文件”),
绘制单个向量可能不会给出非常可读的绘图。
这是另一种方法:向量场描述了一种变形平面上画的东西的方法;
将其应用于白噪声图像

vector_field <- function(
  f,  # Function describing the vector field
  xmin=0, xmax=1, ymin=0, ymax=1,
  width=600, height=600,
  iterations=50,
  epsilon=.01,
  trace=TRUE
) {
  z <- matrix(runif(width*height),nr=height)
  i_to_x <- function(i) xmin + i / width  * (xmax - xmin)
  j_to_y <- function(j) ymin + j / height * (ymax - ymin)
  x_to_i <- function(x) pmin( width,  pmax( 1, floor( (x-xmin)/(xmax-xmin) * width  ) ) )
  y_to_j <- function(y) pmin( height, pmax( 1, floor( (y-ymin)/(ymax-ymin) * height ) ) )
  i <- col(z)
  j <- row(z)
  x <- i_to_x(i)
  y <- j_to_y(j)
  res <- z
  for(k in 1:iterations) {
    v <- matrix( f(x, y), nc=2 )
    x <- x+.01*v[,1]
    y <- y+.01*v[,2]
    i <- x_to_i(x)
    j <- y_to_j(y)
    res <- res + z[cbind(i,j)]
    if(trace) {
      cat(k, "/", iterations, "\n", sep="")
      dev.hold()
      image(res)
      dev.flush()
    }
  }
  if(trace) {
    dev.hold()
    image(res>quantile(res,.6), col=0:1)
    dev.flush()
  }
  res
}

# Sample data
van_der_Pol <- function(x,y, mu=1) c(y, mu * ( 1 - x^2 ) * y - x )
res <- vector_field(
  van_der_Pol,
  xmin=-3, xmax=3, ymin=-3, ymax=3,
  width=800, height=800,
  iterations=50,
  epsilon=.01
)
image(-res)

在您的情况下,向量场不是由函数描述的: 可以使用最近邻的值或某些二维插值
(例如,来自akima软件包)。

以下是pracma软件包的R-Help示例

library(pracma)
f <- function(x, y) x^2 - y^2
xx <- c(-1, 1); yy <- c(-1, 1)
vectorfield(f, xx, yy, scale = 0.1)
for (xs in seq(-1, 1, by = 0.25)) {
    sol <- rk4(f, -1, 1, xs, 100)
    lines(sol$x, sol$y, col="darkgreen")
}
库(pracma)

f添加类似于
箭头(DF[,1],DF[,2],DF[,1]+DF[,3],DF[,2]+DF[,4])
。有关更好的控制,请参见
?箭头。假设有人会给出更好的答案,though@timriffe您应该添加它作为答案,因为OP可能会喜欢
base
解决方案,作为
ggplot2
解决方案的替代方案。您知道是否有类似的方法使用R创建三维向量场吗?嗨,我想知道这是否也可行,但是使用带有几何字段的sf对象,而不是X和Y列。这是一种很酷的方法,但我想说的是,它不太适合于大型数据集:是的,最终输出非常可读,但需要花费大量时间。我不认为从一个随机矩阵开始,仅仅为了一个可视化设备而添加一个循环有什么意义
library(pracma)
f <- function(x, y) x^2 - y^2
xx <- c(-1, 1); yy <- c(-1, 1)
vectorfield(f, xx, yy, scale = 0.1)
for (xs in seq(-1, 1, by = 0.25)) {
    sol <- rk4(f, -1, 1, xs, 100)
    lines(sol$x, sol$y, col="darkgreen")
}
library(pracma)
xyRange <- seq(-1*pi,1*pi,0.2)
temp <- meshgrid(xyRange,xyRange)
u <- sin(temp$Y)
v <- cos(temp$X)
plot(range(xyRange),range(xyRange),type="n",xlab=expression(frac(d*Phi,dx)),ylab=expression(d*Phi/dy))
quiver(temp$X,temp$Y,u,v,scale=0.5,length=0.05,angle=1)