rmarkdown data.table图不'；编译后不匹配

我已经到处寻找答案，我不确定这是否是一个bug，但我还没有发现任何类似的问题，所以我来看看

我（相对而言）不熟悉R中的

data.table

库，但它能够轻松地将内容应用于选择性查询，而不必为所有内容创建函数，这让我在第一次使用它时就卖掉了它

我使用rmarkdown编译报告，并在

DT[I，j，by]

的

j

部分运行绘图。这在Rstudio中工作得很顺利，编辑器按照预期的方式执行我的代码，但在我编译输出的那一刻，绘图就不再符合我想要的（和看到的）了

我已经多次清理并重新启动我的会话，所以我知道这个问题不是由于我的R环境造成的。更奇怪的是，当我在

j

代码中实际打印数据时，它们在输出和编辑器中都是相同的，所以

plot

确实是把这搞砸了

下面是说明我的问题的Rmd代码：

---
title: "data.table plot issue"
author: "Anyone"
date: "27 juin 2018"
output: html_document
---

```{r setup, include=FALSE}
knitr::opts_chunk$set(echo = TRUE)
```

## Building data

```{r}
library(data.table)

tab = data.table(varA = rep(1:4, each=5),
                 varB = rep(1:5, 4),
                 varC = rep(LETTERS[1:4], each=5),
                 varD = rep(c("red", "blue", "green", "hotpink"), each=5))
tab
```

```{r results="hold"}
layout(matrix(1:4, nrow = 2, byrow = T))
a = tab[,{

  print(varA)
  print(varB)
  print(varC)
  print(varD)

  plot(varB, varA, col=varD, ylim=c(0,5), pch=16, main=varC)

  }, by=varC ]
```

这是我在Rstudio中得到的（这是我应该得到的）：

然而，这是我编译后得到的：

打印的变量是正确的，所以我不知道这里有什么问题。我认为这与Rmarkdown编译和它处理绘图的方式有关，但我没有太多的东西要讲

有什么想法吗

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编辑：

版本信息：

• R版本3.3.3（2017-03-06）

• knitr_1.20

• rmarkdown_1.9

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您可以通过使用

浆糊0围绕颜色来强制颜色：

layout(matrix(1:4, nrow = 2, byrow = T))
a = tab[,{

  print(varA)
  print(varB)
  print(varC)
  print(varD)
  plot(varB, varA, col=paste0(varD), ylim=c(0,5), pch=16, main=varC)
  }, by=varC ]

我可以重现这个问题，我的软件包版本是：
rmarkdown\u 1.9
，
knitr\u 1.20
和
数据。表1.11.0
。我正在运行：
R版本3.5.0（2018-04-23）平台：x86_64-w64-mingw32/x64（64位）运行在：Windows>=8 x64（build 9200）
下，可能与@Henrik有关，但奇怪的是，在这里我们得到了相反的效果（Rstudio输出很好，而编译的输出不好）是的，在这种情况下可以做到。不幸的是，绘图的数据列因数据而异。在本例中，是颜色和标题，但在我的一些报告中，打印的实际点受到影响（它为所有打印打印相同的y值，并且正确指定了颜色）。我希望我不必为我所有的情节做这样的修正。谢谢你的意见：）啊，但原则是一样的：力量评估。例如，
plot（varB，varA+0，…）
分配变量不会导致计算吗？我试着做一些类似于
A=varA
的事情，然后在测试期间
plot（A，B，…）
复制（varA）

将复制必须在所有plot@RomainB上进行此类修复的值。我想这可能在一般情况下有效（我没有使用您的示例进行测试）：