Warning: file_get_contents(/data/phpspider/zhask/data//catemap/4/r/64.json): failed to open stream: No such file or directory in /data/phpspider/zhask/libs/function.php on line 167

Warning: Invalid argument supplied for foreach() in /data/phpspider/zhask/libs/tag.function.php on line 1116

Notice: Undefined index: in /data/phpspider/zhask/libs/function.php on line 180

Warning: array_chunk() expects parameter 1 to be array, null given in /data/phpspider/zhask/libs/function.php on line 181

Warning: file_get_contents(/data/phpspider/zhask/data//catemap/2/ssis/2.json): failed to open stream: No such file or directory in /data/phpspider/zhask/libs/function.php on line 167

Warning: Invalid argument supplied for foreach() in /data/phpspider/zhask/libs/tag.function.php on line 1116

Notice: Undefined index: in /data/phpspider/zhask/libs/function.php on line 180

Warning: array_chunk() expects parameter 1 to be array, null given in /data/phpspider/zhask/libs/function.php on line 181
加载BioConductor库“;GO.db";失败_R_Bioconductor - Fatal编程技术网

加载BioConductor库“;GO.db";失败

加载BioConductor库“;GO.db";失败,r,bioconductor,R,Bioconductor,我在加载BioConductor包“GO.db”时遇到问题。 它失败并出现以下错误: 错误:'GO.db'的loadNamespace()中的onLoad失败,详细信息: 调用:sqliteNewConnection(drv…)错误:RS-DBI驱动程序:(无法 连接到数据库名称:无法打开数据库文件)错误:包或 “GO.db”的命名空间加载失败 我在Windows8中工作,使用R3.1.0和Bioconductor 2.14(最新版本) 请帮忙 完整数据: R版本3.1.0(2014-04-1

我在加载BioConductor包“GO.db”时遇到问题。 它失败并出现以下错误:

错误:'GO.db'的loadNamespace()中的onLoad失败,详细信息:
调用:sqliteNewConnection(drv…)错误:RS-DBI驱动程序:(无法 连接到数据库名称:无法打开数据库文件)错误:包或 “GO.db”的命名空间加载失败

我在Windows8中工作,使用R3.1.0和Bioconductor 2.14(最新版本)

请帮忙


完整数据:

R版本3.1.0(2014-04-10)-“春舞”版权所有(C)2014 统计计算平台基金会: x86_64-w64-mingw32/x64(64位)

R是免费软件,绝对没有保修。你是 欢迎在特定条件下重新分发。键入“license()” 或“license()”以获取分发详细信息

R是一个有许多贡献者的协作项目。类型 “贡献者()”了解更多信息,以及“引文()”了解如何引用 出版物中的R或R包

对于某些演示,键入“demo()”;对于联机帮助,键入“help()”;或者 “help.start()”用于HTML浏览器界面的帮助。键入“q()”以 退出R

[以前保存的工作区已恢复]

来源(“”)Bioconductor版本2.14(BioInstaller 1.14.2),?BioLite寻求帮助 BioLite(“GO.db”)生物镜子:使用Bioconductor版本2.14(BioInstaller 1.14.2),R版本 3.1.0. 正在安装程序包“GO.db”正在尝试URL“” 打开的内容类型“应用程序/zip”长度为27089981字节(25.8 Mb) 下载的URL为25.8MB

下载的二进制软件包位于 C:\Users\קובי\AppData\Local\Temp\RtmpCGiNBg\downloaded_软件包

库(“GO.db”)加载所需包:AnnotationDbi加载所需包:BioGenerics加载所需包:并行

附加包装:“生物仿制药”

以下对象被“package:parallel”屏蔽:

clusterApply, clusterApplyLB, clusterCall, clusterEvalQ,
clusterExport, clusterMap, parApply, parCapply, parLapply,
parLapplyLB, parRapply, parSapply, parSapplyLB
以下对象已从“package:stats”屏蔽:

xtabs
以下对象已从“package:base”屏蔽:

anyDuplicated, append, as.data.frame, as.vector, cbind, colnames,
do.call, duplicated, eval, evalq, Filter, Find, get, intersect,
is.unsorted, lapply, Map, mapply, match, mget, order, paste, pmax,
pmax.int, pmin, pmin.int, Position, rank, rbind, Reduce, rep.int,
rownames, sapply, setdiff, sort, table, tapply, union, unique,
unlist
加载所需包:Biobase欢迎使用Bioconductor

Vignettes contain introductory material; view with
'browseVignettes()'. To cite Bioconductor, see
'citation("Biobase")', and for packages 'citation("pkgname")'.
加载所需包:GenomeInfo数据库加载所需包:DBI 错误:'GO.db'的loadNamespace()中的onLoad失败,详细信息:
调用:sqliteNewConnection(drv…)错误:RS-DBI驱动程序:(无法 连接到数据库名称:无法打开数据库文件)错误:包或 “GO.db”的命名空间加载失败


我也有同样的问题。尝试将R重新安装到另一个目录(另一张光盘)。它帮助了我。

命令
BiocInstaller::biocValid()
是否建议任何过期或太新的软件包?另请参阅