使用R中的颜色从绘图填充等高线

使用R中的颜色从绘图填充等高线,r,colors,plot,fill,contour,R,Colors,Plot,Fill,Contour,我有下面的代码,它将生成一个包含多条等高线的绘图。现在,我想用一种特定的颜色填充这些轮廓线或至少一条,例如25%的轮廓线。我尝试了不同的选项,但我不知道如何从特定轮廓中选择多边形区域并用颜色填充它 dd1<-read.table(text="dist depth 4916.64 8.661827 4916.64 14.789091 4916.64 13.555909 4916.64 12.92

我有下面的代码,它将生成一个包含多条等高线的绘图。现在,我想用一种特定的颜色填充这些轮廓线或至少一条,例如25%的轮廓线。我尝试了不同的选项,但我不知道如何从特定轮廓中选择多边形区域并用颜色填充它

dd1<-read.table(text="dist  depth
            4916.64 8.661827
            4916.64 14.789091
            4916.64 13.555909
            4916.64 12.92816
            4916.64 11.708774
            4916.64 15.28
            4916.64 13.369875
            4916.64 14.039655
            4916.64 13.454545
            4916.64 12.638261
            4916.64 13.251081
            4916.64 14.006341
            4916.64 12.64
            4916.64 15.521818
            4916.64 10.202121
            4916.64 14.816667
            4916.64 15.504
            9674.844    23.93
            11000.151   22.157143
            11414.31    22.72
            11414.31    25.7
            11414.31    19.07
            11414.31    23.085714
            9481.57 17.266667
            11414.31    26.8
            11414.31    19.382222
            5616.09 12.016667
            10658.02    18.873913
            11414.31    25.2
            11414.31    20.9
            11414.31    27.65
            11414.31    22.133333
            11414.31    30.9
            5616.09 23.3
            11172.718   20.391667
            9964.755    23.51
            5616.09 19.43
            5616.09 19.1
            4916.64 18.42
            8515.2  17.683333
            11414.31    22.128571
            11414.31    22.8608
            10391.095   24.955882
            10931.125   25.225
            6444.407    20.228571
            11276.257   23.77619
            10585.993   23.285714
            10641.214   20.653333
            9757.676    24.007143
            11414.31    18.817
            11414.31    23.525
            11414.31    22.873684
            11414.31    26.15
            10486.595   21.9
            11000.151   24.142857
            11414.31    24.3875
            10819.621   20.569231
            10360.088   29.345455
            9708.951    21.488235
            11414.31    30.775
            11414.31    25.5
            11414.31    18.477917
            10327.144   26.8625
            11414.31    26.12963
            11414.31    29.28125
            11414.31    23.166667
            10689.532   21.8625
            11414.31    28.328571
            11414.31    22.563158
            11414.31    25.490909
            11414.31    26.0625
            11414.31    34.5
            11414.31    17.375294",header=T)
下面是生成绘图的代码。如有任何建议,将不胜感激

library(ks)
## auto bandwidth selection
H.pi2<-Hpi(dd1,binned=TRUE)*1
ddhat<-kde(dd1,H=H.pi2)

# Kernel contour plot
plot(ddhat,cont=c(95),drawpoints=TRUE,col="black",xlab="Distance (m)",lwd=2.5, 
        ylab="Depth (m)",ptcol="grey15",cex=0.7,
        xlim=c(min(dd1[,1]-dd1[,1]*0.4),max(dd1[,1]+dd1[,1]*0.4)),ylim=c(45,-1)) 

plot(ddhat,cont=c(25),add=TRUE,col="red",lwd=2.4)
plot(ddhat,cont=c(50),add=TRUE,col="seagreen2",lwd=2.4)
plot(ddhat,cont=c(75),add=TRUE,col="royalblue",lty=5,lwd=2.5)  

# End of the script
可以将display=filled.contour2作为参数添加到plot.kde。例如:

plot(ddhat,cont=c(75),add=FALSE,lty=5,lwd=2.5, display="filled.contour2", col=c(NA,"blue"))
plot(ddhat,cont=c(95),drawpoints=TRUE,col="black",xlab="Distance (m)",lwd=2.5, 
      ylab="Depth (m)",ptcol="grey15",cex=0.7,
      xlim=c(min(dd1[,1]-dd1[,1]*0.4),max(dd1[,1]+dd1[,1]*0.4)),ylim=c(45,-1),add=TRUE) 
plot(ddhat,cont=c(50),add=TRUE,lwd=2.4, display="filled.contour2", col=c(NA,"green"))
plot(ddhat,cont=c(25),add=TRUE,lwd=2.4, display="filled.contour2",col=c(NA,"red")) 
其中:


如何指定/更改填充轮廓的颜色?如果我理解正确,可以使用col参数,但矢量为两种颜色:一种用于外部,另一种用于内部。例如:plotddhat,cont=c25,add=FALSE,lwd=2.4,display=filled.tourt2,col=cwhite,blue非常感谢!实际上我只需要改变填充轮廓的颜色。例如,从红色到蓝色,但不是外部。在本例中,我想您必须指定col=cNA,blue?是的,您是对的,您必须使用NA作为第一种颜色,并注意绘图调用的顺序。考虑到这一点,我更新了我的答案。一个快速相关的问题。我尝试在另一个轮廓内核上绘制一个轮廓内核,因此我尝试使用不同的颜色选项和透明度,以便更容易理解最终绘制。但是,由于某种原因,当我将图形导出为PDF时,“填充颜色带透明度”选项会显示一个网格图案,其颜色为例如plotddhat.day、cont=c95、lwd=1、add=F、display=filled.CONTOURT2、col=c0,8B000040。我还尝试使用col=rgb来指定颜色和透明度,但它显示的是相同的。关于如何从填充中删除此网格图案,有什么好的建议吗?