R和bioconductor,为什么getGEO()函数会生成错误;打开连接时出错(x,“rb”):HTTP错误404;?

R和bioconductor,为什么getGEO()函数会生成错误;打开连接时出错(x,“rb”):HTTP错误404;?,r,http,http-status-code-404,bioconductor,R,Http,Http Status Code 404,Bioconductor,我正在运行Linux Ubuntu 18.04.3 LTS的计算机上使用R(版本3.4.4)。 我正在尝试从下载一个具有bioconductor软件包功能的数据集。 数据集地理代码为 出乎意料的是,getGEO()生成了一个HTTP错误404。如何修复它 我正在使用以下R命令: setwd(".") options(stringsAsFactors = FALSE) if (!requireNamespace("BiocManager", quietly = TRUE)) instal

我正在运行Linux Ubuntu 18.04.3 LTS的计算机上使用R(版本3.4.4)。 我正在尝试从下载一个具有bioconductor软件包功能的数据集。 数据集地理代码为

出乎意料的是,getGEO()生成了一个HTTP错误404。如何修复它

我正在使用以下R命令:

setwd(".")
options(stringsAsFactors = FALSE)

if (!requireNamespace("BiocManager", quietly = TRUE))
    install.packages("BiocManager")
BiocManager::install("GEOquery")
library(GEOquery)

GSE_code <- "GSE134381"
gset <- getGEO(GSE_code, GSEMatrix =TRUE, getGPL=FALSE)
setwd(“.”)
选项(stringsAsFactors=FALSE)
如果(!requireNamespace(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))
安装软件包(“BioManager”)
BioManager::安装(“地理查询”)
图书馆(地理查询)

GSE_代码似乎不再存在查询试图访问的数据。您可以尝试向包作者提出问题:。这可能只是一个临时服务器问题。设置
GSEMatrix=FALSE
对mealso有效,因此您的链接会指向不同的数据集