在R包和CRAN检查中分配TMB功能

我在Rcpp的/src-8中有9个cpp文件，在TMB中有1个。我可以编译所有代码并成功运行，或者通过CRAN检查。但不是两者都有

方法1

让R编译所有cpp文件并生成单个DLL:'mypackage.DLL'和

TMB:：MakeADfun（…，DLL=“mypackage”）

：

• 通过所有起重机检查（除了安装的包装尺寸注释，见下文）
• Rcpp函数运行良好
• 调用TMB函数会导致：

  
  .Call中出错（“getParameterOrder”，数据，参数，new.env（），PACKAGE=DLL）：
  “getParameterOrder”不适用于包“mypackage”的.Call（）
  

• 使用

  TMB:：MakeADFun（…，DLL=“mypackage”，checkParameterOrder=FALSE）

  会导致：

  
  .Call中出错（“TMBconfig”，e，as.integer（1），PACKAGE=DLL）：
  “TMBconfig”不适用于包“mypackage”的.Call（）
  

方法2

使用下面的“makevars.win”，添加

useDynLib MyTMB

和

TMB:：MakeADfun（…，DLL=“MyTMB”）

，并创建两个DLL（mypackage.DLL和MyTMB.DLL）：

makevars.win：

all: MyTMB.dll

MyTMB.dll: MyTMB.cpp
    $(R_HOME)/bin$(R_ARCH_BIN)/Rscript --vanilla -e "TMB::compile('MyTMB.cpp', safebounds=FALSE, safeunload=FALSE)"

clean:
  rm -rf *o

• Rcpp和TMB功能都可以工作
• devtools:：check（）会对每个Rcpp函数产生一个警告：

  checking foreign function calls ... WARNING
      Foreign function calls to a different package:
        .Call("_rcppfunction1", ..., PACKAGE = "mypackage")
  

• 还有一个关于大安装包尺寸的注意事项。

  libs

  子目录的大小超过30 Mb，大约是方法1的两倍

Rcpp开发人员推荐，很明显，我正在覆盖Rcpp中的某些内容，以导致“外部函数调用”问题，即使包是当前包。我的选择似乎是：

• 修改“makevars”以恢复避免警告的Rcpp默认值，并请求CRAN接受关于已安装软件包大小的说明。不知道如何做前者
• 找到解决方法1问题的方法，并请求安装较小的软件包。只有一个dll是最简单的解决方案。不确定问题是否是由于我同时编译Rcpp和TMB引起的，如果是，如何修复它
• 或者其他我错过的东西

有什么建议吗

R详细信息：

平台x86_64-w64-mingw32
拱门x86_64
os mingw32
系统x86_64，mingw32
状态
专业3

---

minor 3.3

GetPareMetErrorder错误是因为缺少dyn.load（）？我应该说清楚-我在方法1的命名空间中使用了

useDynLib（mypackage）

，Rcpp代码工作正常，即找到dll。抱歉，这没有回答您的问题，但是我想知道如何让方法2从

Rcpp

文件编译

mypackage.dll

？当我使用自定义

makefile.win

编译

TMB

文件时，我得到以下错误：

library.dynam（lib，package，package.lib）中的错误：未找到DLL'debugrcpp'：可能未为此体系结构安装？

，也就是说，如果提供了

makefile

，它就不会编译

Rcpp

文件。@Alex你的makefile看起来像我的吗？我的Rcpp是自动编译的，TMB生成文件似乎没有影响它。我的生成文件看起来和你的相似。我使用链接线程中的一个：