Regex 提取两个标记之间的文本并替换字符

我想换衣服

>lcl|ORF183:9482:8118 unnamed protein product

进入

将所有内容保留在

|

之后和“空白”之前，并将第二个

：

替换为

-

到目前为止，我正在使用以下代码执行此操作：

sed -e '/^>/s/ .*//' -e '/^>/s/|/ /' -e '/^>/s/lcl //' -e '/^>/s/\(.*\):/\1-/'

但我希望用更简单的一行代码来实现这一点。

这可以：

sed -e 's/\(^.*|\)\(.*\):\(.*\):\(.*\)[[:space:]]\(unnamed.*$\)/>\2:\3-\4/' 

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以下是基于您尝试过的代码的一些改进

$ sed -e '/^>/s/ .*//' -e '/^>/s/lcl|//' -e '/^>/s/:/-/2' ip.txt
>ORF183:9482-8118

• -e'/^>/s/|/'-e'/^>/s/lcl/'

  可以简化为

  -e'/^>/s/lcl |/'

  • 如果希望匹配
    和
    之间的任何文本，请使用

    s/>[^ |]*.//

• sed

  允许指定要替换的匹配项的哪个匹配项，

  s/：/-/2

  表示将第二个

  ：

  替换为

  -

如果您的

sed

实现允许分组，您可以将

{}

中的所有命令（用

；

分隔）分组到特定地址

$ sed '/^>/{s/ .*//; s/lcl|//; s/:/-/2}' ip.txt
>ORF183:9482-8118

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请访问awk以获取学习资源和其他好处：

awk-F'[|]'{print'>“$2}

sed-e's/>lcl |或F183:9482:8118未命名蛋白质产品/>或F183:9482:8118/

欢迎访问该网站！您应该知道，正则表达式是用来识别模式的，我们不能假设哪些字符会发生变化，哪些字符会始终保持不变，因此我们不能给出一个优雅的解决方案，您可以在其他示例中使用，而无需您提供额外的信息。我建议你试试regexr.com网站，使用控制组和游戏。

$ sed '/^>/{s/ .*//; s/lcl|//; s/:/-/2}' ip.txt
>ORF183:9482-8118