Shell 如何从另一个文件中查找包含任何字符串的行？

我有2个csv文件。文件A，包含多个列。文件B，有一列。 例如：

文件A：

chr1 100000 100022 A C GeneX
chr2 200000 200033 X GeneY
chr3 300000 300055 G A GeneZ

文件B：

GeneY
GeneZ

我希望我的输出是：

chr2 200000 200033 X GeneY
chr3 300000 300055 G A GeneZ

我试过使用

grep

（崩溃）和其他工具。

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我肯定有一个非常简单的答案，我就是看不到

使用

grep-f

grep -f FileB FileA

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下面是如何使用

awk

awk 'FNR==NR {a[$0];next} {for (i in a) if (i~$1) print i}' FileA FileB
chr2 200000 200033 X GeneY
chr3 300000 300055 G A GeneZ

或者像这样：

awk 'FNR==NR {a[$0];next} ($NF in a)' FileB FileA
chr2 200000 200033 X GeneY
chr3 300000 300055 G A GeneZ

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谢谢你，阿米特。不幸的是，当我尝试在大型数据集上运行此操作时，我收到了一条内存不足的错误消息。@ChrisDias-您可以在使用

export LC_ALL=C

设置区域设置后再试。来源-如果

grep

崩溃，您在哪个平台上？您正在处理的文件有多大？您说您在尝试

grep-f FileB FileA

时遇到了“内存不足”错误。在这种情况下，最好的办法可能是将

FileB

分割成足够小的部分，以便在不发生

grep

崩溃的情况下进行处理。这样做的明显缺点是，与原始的

FileA

相比，结果集中的行将出现顺序错误。如果

FileB

中的两个单词可以出现在一行中，那么您也可能以重复结尾。

sed

效果更好吗？Perl呢？如果

sed

或

grep

或Perl都不起作用，那么您可能会找到更好的方法来编码信息并编写自己的处理程序。但这是最后的手段，取决于许多问题中尚未描述的因素。谢谢。我没能让塞德去上班，真倒霉。请确定您正在使用的平台，以及两个文件的大小（两个文件的行数和字节大小都很有用）。文件A只是1500行中的一列。文件B是1.2M，有5800个。谢谢Jotne。我尝试了这个，但是得到了一个空输出。我有两个文件作为.csv和制表符分隔的.txt；两者都不起作用。@ChrisDias它可以很好地处理上面的数据。那么您的数据的格式就不同了。