使用awk的类似行的和值

从下面的例子中，我想对

目标

和

miRNA

相似的行的分数求和：请参见下文

 Target       miRNA                 Score
 NM_198900    hsa-miR-423-5p       -0.244
 NM_198900    hsa-miR-423-5p       -0.6112
 NM_1989230   hsa-miR-413-5p       -0.644
 NM_1989230   hsa-miR-413-5p       -0.912

输出：

NM_198900      hsa-miR-423-5p       -0.8552
NM_1989230     hsa-miR-413-5p       -1.556

像这样：

awk '{x[$1 " " $2]+=$3} END{for (r in x)print r,x[r]}' file

当它看到每一行时，它会将第三个字段（

$3

）添加到一个数组

x[]

，通过在字段1和字段2之间加一个空格进行索引。最后，它将打印

x[]

的所有元素

按照@jaypal的建议，您可能更喜欢保留标题行（NR==1）并使用制表符作为输出字段分隔符

awk 'NR==1{OFS="\t";print;next} {x[$1 OFS $2]+=$3} END{for (r in x)print r,x[r]}' file

像这样：

awk '{x[$1 " " $2]+=$3} END{for (r in x)print r,x[r]}' file

当它看到每一行时，它会将第三个字段（

$3

）添加到一个数组

x[]

，通过在字段1和字段2之间加一个空格进行索引。最后，它将打印

x[]

的所有元素

按照@jaypal的建议，您可能更喜欢保留标题行（NR==1）并使用制表符作为输出字段分隔符

awk 'NR==1{OFS="\t";print;next} {x[$1 OFS $2]+=$3} END{for (r in x)print r,x[r]}' file

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你的文件分类了吗？可以排序吗？你可以排序，是的。你的文件排序了吗？可以排序吗？您可以排序，可以。+1：您可能希望按原样打印标题行，并从第二行开始添加。另外，将

subsp

变量设置为

FS

允许您使用更干净的组合键形式

x[$1，$2]

@jaypal:是的，谢谢。我做了相应的修改。+1：您可能希望按原样打印标题行，并从第二行开始添加。另外，将

subsp

变量设置为

FS

允许您使用更干净的组合键形式

x[$1，$2]

@jaypal:是的，谢谢。我已作出相应的修订。