如果在文件中找不到id，则awk将缺失添加到顺序中

下面的

awk

将在

file2

的

$2

中的

file1

中查找ID，如果它们匹配，则打印

$2

。如果在

file2

（如ARRR和AAAA）中缺少或未找到id，我无法找出如何将其添加到输出中的行中，因为在

$3

中缺少相同的格式。也就是说，

$1

中的下一个序列号，

$2

中的

文件1

中的id，以及

$3

中缺少的单词。谢谢：）

awk

awk -F'\t' 'NR==FNR{A[$1];next}$2 in A' file1 file2

文件1

空格分隔

AARS
AARS2
AARS2;TMEM151B
ARRR
AAAS
AAAA
AADAC

文件2

制表符分隔

1   AARS     100.00
2   AARS2    100.00
3   AARS2;TMEM151B   100.00
4   AAAS     100.00
5   AADAC    100.00

1   AARS     100.00
2   AARS2    100.00
3   AARS2;TMEM151B   100.00
4   AAAS     100.00
5   AADAC    100.00
6   ARRR    missing
7   AAAA    missing

所需输出

制表符分隔

1   AARS     100.00
2   AARS2    100.00
3   AARS2;TMEM151B   100.00
4   AAAS     100.00
5   AADAC    100.00

1   AARS     100.00
2   AARS2    100.00
3   AARS2;TMEM151B   100.00
4   AAAS     100.00
5   AADAC    100.00
6   ARRR    missing
7   AAAA    missing

awk解决方案：

awk 'NR==FNR{ a[$0]; next }$2 in a{ delete a[$2] }
     END{ for(i in a) print ++FNR,i,"missing" }1' file1 OFS='\t' file2

输出：

1   AARS     100.00
2   AARS2    100.00
3   AARS2;TMEM151B   100.00
4   AAAS     100.00
5   AADAC    100.00
6   AAAA    missing
7   ARRR    missing