Awk 在不更改索引的情况下更改列if条件中的值_Awk

Awk 在不更改索引的情况下更改列if条件中的值

awk

Awk 在不更改索引的情况下更改列if条件中的值,awk,Awk,以下是我需要更改的一些值：如果第一列为2=>1 如果第一列为8=>2 如果第一列为16=>3 CHR SNP BP A1 TEST NMISS BETA STAT P 2 rs10173732 31404 A ADD 2607 -0.02162 -1.552 0.1207 2 rs10173732

以下是我需要更改的一些值：

如果第一列为2=>1

如果第一列为8=>2

如果第一列为16=>3

CHR          SNP         BP   A1       TEST    NMISS       BETA         STAT            P 
   2   rs10173732      31404    A        ADD     2607   -0.02162       -1.552       0.1207
   2   rs10173732      31404    A       COV1     2607     0.2659        24.15   1.849e-116
   2   rs11684864    2547285    G        ADD     2596  -0.009581      -0.6387       0.5231
   2   rs11684864    2547285    G       COV1     2596     0.2672        24.18   1.212e-116
   2   rs11684864    2547285    G       COV2     2596   0.004941        9.564    2.548e-21
   8    rs3826201   88651817    T       COV3     2576    -0.0186        -15.7    4.335e-53
  16    rs8047319   88684276    C        ADD     2538    0.01115        1.271        0.204
  16    rs8047319   88684276    C       COV1     2538     0.2632        23.73   1.402e-112
  16    rs8047319   88684276    C       COV2     2538   0.005039        9.715    6.276e-22
  16    rs8047319   88684276    C       COV3     2538   -0.01891        -15.9    2.583e-54

但是，此命令并不方便，因为它会更改缩进，并且带有8的行似乎不太适合：

awk '{ if ( $1 == 2 ) { $1 = 1 } else if ( $1 == 8 ) { $1 == 2 } else if ( $1 == 16 ) { $1 = 3 }; print}' TEST > TESTnew

输出：

 CHR          SNP         BP   A1       TEST    NMISS       BETA         STAT            P 
1 rs10173732 31404 A ADD 2607 -0.02162 -1.552 0.1207
1 rs10173732 31404 A COV1 2607 0.2659 24.15 1.849e-116
1 rs11684864 2547285 G ADD 2596 -0.009581 -0.6387 0.5231
1 rs11684864 2547285 G COV1 2596 0.2672 24.18 1.212e-116
1 rs11684864 2547285 G COV2 2596 0.004941 9.564 2.548e-21
       8    rs3826201   88651817    T       COV3     2576    -0.0186        -15.7    4.335e-53
3 rs8047319 88684276 C ADD 2538 0.01115 1.271 0.204
3 rs8047319 88684276 C COV1 2538 0.2632 23.73 1.402e-112
3 rs8047319 88684276 C COV2 2538 0.005039 9.715 6.276e-22
3 rs8047319 88684276 C COV3 2538 -0.01891 -15.9 2.583e-54

您如何更正更通用的内容（即即使特定行的缩进不同，它也可以工作），并且不会改变原始文件的缩进？

您可以在

sed

中进行替换：

sed 's/^\( *\)2/\11/ ; s/^\( *\)8/\12/ ; s/^\( *\)16/\1 3/'

这将在一个脚本中完成所有三个替换

^\（*\）

捕获行首和数字之前的所有空格<代码>\1替换它们以保留缩进。出于同样的原因，我将

替换为

。

替换为GNU awk，以匹配第三个参数（）

如果1、2和3值只是一个增量索引：

$ awk 'BEGIN{split("2 8 16",t); for (i in t) m[t[i]]=i} $1 in m{match($0,/(\s*\S+)(.*)/,a); $0=sprintf("%*s",length(a[1]),m[$1]) a[2]} 1' file
CHR          SNP         BP   A1       TEST    NMISS       BETA         STAT            P
   1   rs10173732      31404    A        ADD     2607   -0.02162       -1.552       0.1207
   1   rs10173732      31404    A       COV1     2607     0.2659        24.15   1.849e-116
   1   rs11684864    2547285    G        ADD     2596  -0.009581      -0.6387       0.5231
   1   rs11684864    2547285    G       COV1     2596     0.2672        24.18   1.212e-116
   1   rs11684864    2547285    G       COV2     2596   0.004941        9.564    2.548e-21
   2    rs3826201   88651817    T       COV3     2576    -0.0186        -15.7    4.335e-53
   3    rs8047319   88684276    C        ADD     2538    0.01115        1.271        0.204
   3    rs8047319   88684276    C       COV1     2538     0.2632        23.73   1.402e-112
   3    rs8047319   88684276    C       COV2     2538   0.005039        9.715    6.276e-22
   3    rs8047319   88684276    C       COV3     2538   -0.01891        -15.9    2.583e-54

或者根本不需要指定现有的$1值：

$ awk 'NR>1{ if ($1!=p) {c++; p=$1} match($0,/(\s*\S+)(.*)/,a); $0=sprintf("%*s",length(a[1]),c) a[2]} 1' file
CHR          SNP         BP   A1       TEST    NMISS       BETA         STAT            P
   1   rs10173732      31404    A        ADD     2607   -0.02162       -1.552       0.1207
   1   rs10173732      31404    A       COV1     2607     0.2659        24.15   1.849e-116
   1   rs11684864    2547285    G        ADD     2596  -0.009581      -0.6387       0.5231
   1   rs11684864    2547285    G       COV1     2596     0.2672        24.18   1.212e-116
   1   rs11684864    2547285    G       COV2     2596   0.004941        9.564    2.548e-21
   2    rs3826201   88651817    T       COV3     2576    -0.0186        -15.7    4.335e-53
   3    rs8047319   88684276    C        ADD     2538    0.01115        1.271        0.204
   3    rs8047319   88684276    C       COV1     2538     0.2632        23.73   1.402e-112
   3    rs8047319   88684276    C       COV2     2538   0.005039        9.715    6.276e-22
   3    rs8047319   88684276    C       COV3     2538   -0.01891        -15.9    2.583e-54

我删掉了第一行。这不是胡说八道，就是你承认浪费了我们的时间。不管怎样，这都是不合适的。除此之外，好问题，您是否愿意使用

sed

？好的，谢谢！当然，我愿意使用

sed

。只是我不熟悉在不同的条件下使用它，但是欢迎任何好的想法。我只是在这里找到了如何做到这一点：。显然，这只是分号，而不是使用

print

打印行，您可以使用

printf（）

指定列宽。感谢您将我推到10k以上！Ed你肯定可以用awk一号线偷走死星计划！我以为我很了解awk。。。

$ awk 'NR>1{ if ($1!=p) {c++; p=$1} match($0,/(\s*\S+)(.*)/,a); $0=sprintf("%*s",length(a[1]),c) a[2]} 1' file
CHR          SNP         BP   A1       TEST    NMISS       BETA         STAT            P
   1   rs10173732      31404    A        ADD     2607   -0.02162       -1.552       0.1207
   1   rs10173732      31404    A       COV1     2607     0.2659        24.15   1.849e-116
   1   rs11684864    2547285    G        ADD     2596  -0.009581      -0.6387       0.5231
   1   rs11684864    2547285    G       COV1     2596     0.2672        24.18   1.212e-116
   1   rs11684864    2547285    G       COV2     2596   0.004941        9.564    2.548e-21
   2    rs3826201   88651817    T       COV3     2576    -0.0186        -15.7    4.335e-53
   3    rs8047319   88684276    C        ADD     2538    0.01115        1.271        0.204
   3    rs8047319   88684276    C       COV1     2538     0.2632        23.73   1.402e-112
   3    rs8047319   88684276    C       COV2     2538   0.005039        9.715    6.276e-22
   3    rs8047319   88684276    C       COV3     2538   -0.01891        -15.9    2.583e-54