Awk 更改文本文件的外观

我有一个文本文件如下

>1KKW
IYLCAVLLIL
>1WY6
GSLLILKR
>1Z23
LTLQQVINLAFQ
>1ZQS

>2B25
AV
>2L3Z
LLIL
>2OPT

>3AZO
SFNVAKR

我想安排上述文件如下所示。我怎样才能用awk做到这一点？谢谢你的帮助

期望输出

1KKW     IYLCAVLLIL
1WY6     GSLLILKR
1Z23     LTLQQVINLAFQ
1ZQS     no residues
2B25     AV
2L3Z     LLIL
2OPT     no residues
3AZO     SFNVAKR

---

这是一个

awk

awk 'NF {$2="\t"($2==""?"no residues":$2)} NF' RS=\> file
1KKW    IYLCAVLLIL
1WY6    GSLLILKR
1Z23    LTLQQVINLAFQ
1ZQS    no residues
2B25    AV
2L3Z    LLIL
2OPT    no residues
3AZO    SFNVAKR

这里我确实使用了

作为记录选择器，因为它应该给出行的开头

---

然后将下一个数据打印为

$2

，如果

$2

中没有数据，请使用

“无残留”

这是一个多行

sed

解决方案

命令：

sed -e '{
N
s/\n/\t/
s/>//g
s/\t$/\tno residues/g
}' text.txt

结果:

---

您可以将“\t”移动到赋值前面的公共区域，而不是复制它。由于非括号三元表达式，它将在某些AWK中失败并出现语法错误，并且如果$2包含计算结果为数字零的字符串，它将错误地打印“无剩余”。它应该写为：

awk'NF{$2=“\t”（$2==”？“无残留物”：$2）}NF'RS=\>文件

，但我想它会更清晰，因为

awk'NR>1{$2=“\t”（$2==”？“无残留物”）：$2；print}'RS=\>文件

@EdMorton我也看到了那个解决方案，但去掉

\t

并没有保存任何字节，因为我需要添加

。但它看起来更干净，所以我改变了它。@Jotne是的，我不知道历史是什么或标准是怎么说的，但在OSX上的awk中，例如，在某些情况下可以使用非括号三元表达式，但在其他情况下不能使用。例如，这很好：
awk'BEGIN{printf”%s\n，NR%3？0:$1}'
这很好：
awk'BEGIN{printf”%s\n'，（NR==3？0:$1）}'
但这是一个语法错误：
awk'BEGIN{printf”%s\n'，NR==3？0:$1}'
。与其担心如果没有帕伦斯，它是否会失败，我认为最好总是用括号括起来。@EdMorton观点和解释都很好。我确实喜欢便携的解决方案，所以记住所有这些调整和技巧是很重要的。不公平，你还没有任何开明或好的答案徽章+1感谢迄今为止在awk标签上所做的所有出色工作！是的，我知道这个问题需要一个awk解决方案。因为已经提供了两个awk解决方案，所以我加入了一个sed解决方案。真的有必要否决它吗？你刚刚采纳了我的高尔菲德解决方案，让它变得更糟，并将其作为你自己的方案发布。事实上，我从未见过你的高尔菲德解决方案。我相信你是一位出色的sed专家，但这一行是使用sed手册页和我头脑中已有的信息独立创建的。是的，它并不完美，因为它在一条线上完成了3次传球，但我从来没有说过它是完美的。
1KKW    IYLCAVLLIL
1WY6    GSLLILKR
1Z23    LTLQQVINLAFQ
1ZQS    no residues
2B25    AV
2L3Z    LLIL
2OPT    no residues
3AZO    SFNVAKR

$ awk '{printf "%s", ( sub(/^>/,"") ? $0"\t" : (NF?$0:"no residues")ORS )}' file
1KKW    IYLCAVLLIL
1WY6    GSLLILKR
1Z23    LTLQQVINLAFQ
1ZQS    no residues
2B25    AV
2L3Z    LLIL
2OPT    no residues
3AZO    SFNVAKR